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有时候在使用Olex2进行结构精修的时候，在Olex2操作界面填入的信息无法写入CIF文件。案例如下。 晶体数据所在文件夹文件情况如图1所示： ▲图1 数据文件 Olex2中Report>>SourceFiles中也正确读取晶体参数文件cif_od（理学单晶衍射仪记录仪器信息、晶胞参数等信息的文件），如图2所示。 ▲图2 Report>>Source Files中文件读取情况 在Report>>Crystal中填入了晶体描述（plate），以及绝对结构确定方法（Anomalousdispersion），如图3所示。 ▲图3 Report中相关信息填写情况 然而在调用PLATON进行结构验证（StructureValidation）时，却出现了如图4所示的AB类警报。 ▲图4 相关AB类警报 打开CIF文件，发现很多信息的参数缺失，全都是问号，如图5–6所示。 ▲图5 CIF文件中缺失的参数1 ▲图6 CIF文件中缺失的参数2 对于这种情况，可以点击如图7所示的Merge CIF按钮。 ▲图7 Report选项卡下的Merge CIF按钮 点击Merge CIF按钮后，Olex2界面左下角提示“All 21 conflictshave been resolved”，并且自动打开CIF，可以看的，CIF中那些原来是问号的条目均已填上相应的信息，如图8–10所示。 ▲图8 点击Merge CIF按钮后填入CIF的相关信息1 ▲图9 点击Merge CIF按钮后填入CIF的相关信息2 ▲图10 点击Merge CIF按钮后填入CIF的相关信息3 此时关闭CIF文件。 千万不要精修！ 千万不要精修！ 千万不要精修！ 因为精修就会产生新的CIF文件，并把已填好信息的CIF文件给覆盖掉。 关掉CIF文件后，直接调用PLATON进行结构验证，则之前出现的AB类警报已消失，如图11所示。 ▲图11 最终的结构验证结果 如果还需要进行精修，那么在精修全部完成后，点击Merge CIF按钮，点完后就不要再精修了，点完Merge CIF按钮产生的CIF文件就是最新的已经解决问题的最终CIF文件。 如需PDF文档，请从以下链接下载： 通过网盘分享的文件：Olex2结构精修时信息无法写入CIF的解决方案.pdf
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发表于 2025-4-25 06:48:04
