无序示例-2-萘甲酸取向无序

DJ_Tokyo

无序示例-2-萘甲酸取向无序

文本所用软件/程序

GUI: Olex2[1]    Refinement: SHELXL[2]

最近处理一个晶体数据，结构中有一个2-萘甲酸结构片段，其原子椭球有点拉长，并且其附近的残余峰很明显可以构成另一个取向的2-萘甲酸骨架，如图1所示。

▲图1 2-萘甲酸原子椭球及其附近残余峰情况

根据上述分析，无序方案很容易设计，如图2所示。

▲图2 无序方案设计

按照无序方案设计对该2-萘甲酸做二组分取向无序，随后用SAME指令（参阅推文“SHELXL指令之SAME”）和SIMU指令（参阅推文“SHELXL指令之SIMU”）分别对两个无序组分的几何结构和原子各向异性位移参数进行限制，结果如图3所示，R因子大幅度下降。

▲图3 2-萘甲酸取向无序处理结果

参考文献

[1] Dolomanov, O.  V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,  Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.    [2] (a)  Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,  University of Göttingen, Germany, 2019. (b)  Sheldrick, G. M. A Short History of SHELX.  Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. Crystal Structure  Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle,  C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors  for SHELXL – model, implementation and  application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI: 10.1107/S2053273318013840.

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