Olex2加氢提示not applicable to grown structures

DJ_Tokyo

Olex2加氢提示not applicable to grown structures

最近，B站有小伙伴留言如图1所示问题，在Olex2[1]中输入指令hadd加氢，结果程序提示“not applicable to grown structures”（不适用于生长的结构）。

▲图1 问题描述

其实晶体结构解析和精修，建模和处理的模型是不对称单元ASU（asymmetryunit）结构，即最小重复单元，ins文件和CIF[2]文件中也只包含ASU结构的原子，其他诸如生长、堆积结构都是ASU结构通过对称操作得到的。

所以，当在Olex2中进行任何遇到“not applicable to grown structures”提示的操作时，只需要回到ASU结构后再操作即可。在Olex2中可以输入fuse并回车以回到ASU结构，或者点击Work>>ToolboxWork>>Growing>>Grow下拉列表中的Asymm. Unit (fuse)选项，如图2所示。

▲图2 Asymm. Unit (fuse)选项

视频讲解和操作演示请参阅：

Olex2加氢提示not applicable to grown structures：https://www.bilibili.com/video/BV1emBwYAE5N

参考文献

[1]    Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726.

[2]    (a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D.The Crystallographic Information File (CIF): A New Standard Archive File forCrystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.

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