更新已申请CCDC号晶体数据的2种结果

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更新已申请CCDC号晶体数据的2种结果

最近，B站有网友按照笔者的视频“如何更新已申请CCDC号的晶体数据：https://www.bilibili.com/video/BV1Pm4y1R7kv”所述到CCDC[1]更新CIF[2]文件，发现CCDC没有用新上传的CIF文件替换原来的CIF文件，而是为新上传的CIF分配了一个新的CCDC号，如图1所示。

▲图1 问题描述

正好笔者也有两个需要更新CIF文件的数据，于是进行如下操作，在申请CCDC时，在More information中输入希望更新CIF文件的CCDC号2408317，然后上传新的CIF文件，如图2所示，随后按步骤完成后面的步骤。

▲图2 更新CIF文件

随后，第二天得到结果是CCDC为新上传的CIF文件分配了新的CCDC号2408652，如图3所示。

▲图3 同一个结构分配的2个CCDC号

分配2个CCDC号可能是因为两者晶胞参数存在差异（CCDC 2408317做了孪晶拆分，CCDC 2408652则正常还原），所以CCDC官方认为是2个不同的数据，如图4所示。

▲图4 CCDC 2408317和CCDC 2408652的晶胞参数

而另一个CCDC2408318的数据上传新的CIF文件进行更新，如图5所示。

▲图5 CCDC 2408318更新CIF文件

则是成功更新了CIF文件，Deposited On由06/12/2024更新为07/12/2024，如图6所示。

▲图6 成功更新CIF文件的晶体数据CCDC 2408318

两者晶胞参数其实也有微小差异，如图7所示，不过CCDC官方判定为相同，并未给新上传的CIF分配新的CCDC号。

▲图7 CCDC 2408318的晶胞参数

这两个数据，一开始当作孪晶处理，然后在2024年12月6日上传至CCDC，得到了CCDC号，紧接着发现其实做孪晶拆分，拆分的第二个晶畴组分比例非常小，按照正常还原解析得到的数据更好，于是在第二天，也就是2024年12月7日上传至CCDC跟新CIF文件，然后等到2024年12月9日，得到上述结果，前一个直接分配了新的CCDC号，而后一个则正常完成了CIF文件的替换更新。

通过上述案例可知，更新已申请CCDC号的晶体数据CIF文件时，经CCDC官方审查，有可能分配新的CCDC号，也有可能正常更新替换CIF文件，不论是哪种结果，接受即可。

如果是论文审稿意见修正后去CCDC更新CIF文件，结果分配了新的CCDC号，那么将论文中的CCDC号修正为新的CCDC号即可。

视频讲解请参阅：

更新已申请CCDC号晶体数据的2种结果：https://www.bilibili.com/video/BV1fbq2YFEx7

参考文献

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[2]    (a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D.The Crystallographic Information File (CIF): A New Standard Archive File forCrystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.

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