查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查2 案例来源:CCDC[1] 2086294. J. Hangzhou Norm. Univ. Nat. Sci. Ed. 2022,21, 119‒123. DOI[2]: 10.19926/j.cnki.issn.1674-232X.2022.02.002. 该论文早在2021年已然发表,如图1所示。 ▲图1 论文发表时间 在论文中第3页可以找到晶体结构的CCDC存储号为2086294,如图2所示。 ▲图2 论文中提供的CCDC存储号 在CCDC服务Access Structures中输入CCDC号查询其CIF[3]文件(参阅推文“通过CCDC号下载CIF文件”或视频“CCDC-Access Structures-根据CCDC号查找CIF文件:https://www.bilibili.com/video/BV1ZM4y1f7BJ”),结果如图3‒4所示,查无此果,这是因为论文刚在线,CCDC数据库中还未将其公开。 ▲图3 查询信息 ▲图4 查询结果 晶体数据除了期刊编辑、审稿人审查之外,CCDC官方也会进行审查,所以晶体数据除了会收到审稿人的审查意见之外,还会收到CCDC官方的审查意见,前者通过后晶体数据就随着论文发表一起公开了,但后者通过后才会在CCDC数据库中公开。 CCDC审查意见案例: 对于论文已在线,但CCDC中尚未公开的晶体数据,在查询结果页面可以填写CCDC存储号和论文期刊信息来请求数据,如图5所示,红色星号选项为必填项,在Name、Email和Institution中填写请求人的姓名、电子邮箱和单位,在Deposition Number(s) or DatabaseIdentifier(s) for one paper中填写所要请求的晶体数据的CCDC存储号。 ▲图5 填写请求人信息和所请求晶体数据的CCDC存储号 再往下,需要填写期刊名称(Journal)和晶体数据所在论文的作者(Author Names),其它的诸如论文的年、卷、页和DOI等也尽量填上,如图6所示。 ▲图6 填写晶体数据所在论文信息 点击Send后,页面跳转如图7所示,表示很快会有联系。 ▲图7 发送请求后反馈结果 大约过了几天,在图5步骤中填写的电子邮箱收到如图8‒9所示邮件,该晶体数据在CCDC数据库中仍为Unpublished状态,因此官方无法确认其发表状态,并表示如果可能的话,请提供论文电子版文档或论文网址。 ▲图8 请求结果邮件 ▲图9 请求结果邮件 于是笔者将论文PDF文档发过去了,如图10所示。 ▲图10 将论文PDF文档发给CCDC官方 随后,大概数分钟后,CCDC官方发来邮件,其中有一个链接,如图11所示。 ▲图11 CCDC官方返回的数据获取链接 将上述链接打开后,得到如图12所示结果,可以下载该晶体数据的CIF文件。 ▲图12 请求数据下载界面 本案例也相当于邮件和CCDC官方交流获取CIF文件了,之前有小伙伴在笔者B站曾留言给出过此类建议,如图13所示。 ▲图13 热心网友的经验与建议 经过上述折腾后,笔者再次尝试在AccessStructures中按该CCDC存储号进行查询,可以查到该晶体结果,这相当于帮助该晶体数据更新了论文期刊信息。 实际上很多国内期刊上发表的晶体数据,虽然也有申请CCDC存储号,并且也在论文中提供了CCDC存储号,但CCDC官方似乎无法获得这些晶体数据的论文期刊信息,所以这些晶体数据在CCDC数据库中一直处于Unpublished状态,因此这些期刊上的晶体数据通过CCDC存储号无法查到结果。 如果晶体数据主人能够登录CCDC账号更新这些晶体数据的期刊论文信息(参阅视频“CCDC-更新已发表结构的期刊信息:https://www.bilibili.com/video/BV1SA41167XW”),则能够这些晶体数据在CCDC上公开,进而有需要的人就可以通过CCDC存储号或DOI号(参阅推文“通过DOI号下载CIF文件”或视频“CCDC-Access Structures-根据DOI查找CIF文件:https://www.bilibili.com/video/BV1Lb41197UH”)在CCDC数据库中查到这些晶体数据。 或者是像本文所述方法,数据请求者向CCDC官方提供晶体数据所发表的论文信息从而促使已随论文发表的晶体数据在CCDC数据库中的公开。 视频讲解请参阅: 查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查2:https://www.bilibili.com/video/BV1jdfSYREoi 参考文献 [1] (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI:10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2. [2] (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System. http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization for Standardization(2022). ISO 26324:2022. Information andDocumentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查2.pdf
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