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[CIF下载] 查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查

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发表于 2025-4-16 15:19:33 | 查看全部 |阅读模式
查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查
案例来源:CCDC[1] 2393549. Angew. Chem. Int. Ed. 2025, e202421412. DOI[2]: 10.1002/anie.202421412.
该论文最近(2025124日)刚刚在线,如1所示。
1 论文发表时间
该论文中支持信息(SupportingInformation)中第154页可以找到Int-2晶体结构的CCDC存储号为2393549,如2所示。
2 论文支持信息中提供的CCDC存储号
CCDC服务Access Structures中输入CCDC号查询其CIF[3]文件(参阅推文“通过CCDC号下载CIF文件”或视频“CCDC-Access Structures-根据CCDC号查找CIF文件:https://www.bilibili.com/video/BV1ZM4y1f7BJ”),结果如3所示,查无此果,这是因为论文刚在线,CCDC数据库中还未将其公开。
3 查询结果
晶体数据除了期刊编辑、审稿人审查之外,CCDC官方也会进行审查,所以晶体数据除了会收到审稿人的审查意见之外,还会收到CCDC官方的审查意见,前者通过后晶体数据就随着论文发表一起公开了,但后者通过后才会在CCDC数据库中公开。
CCDC审查意见案例:
对于论文已在线,但CCDC中尚未公开的晶体数据,在查询结果页面可以填写CCDC存储号和论文期刊信息来请求数据,如4所示,红色星号选项为必填项,在NameEmailInstitution中填写请求人的姓名、电子邮箱和单位,在Deposition Number(s) or DatabaseIdentifier(s) for one paper中填写所要请求的晶体数据的CCDC存储号。
4 填写请求人信息和所请求晶体数据的CCDC存储号
再往下,需要填写期刊名称(Journal)和晶体数据所在论文的作者(Author Names),其它的诸如论文的年、卷、页和DOI等也尽量填上,如5所示。
5 填写晶体数据所在论文信息
点击Send后,页面跳转如6所示,表示很快会有联系。
6 发送请求后反馈结果
大约过了几分钟,在4步骤中填写的电子邮箱收到如7所示邮件,给了一个链接。
7 请求结果邮件
将上述链接打开后,得到如8所示结果,可以下载该晶体数据的CIF文件。
8 请求数据下载界面
视频讲解请参阅:
查不到的CIF可以让CCDC官方帮忙查:https://www.bilibili.com/video/BV1XBf2YzEsS
参考文献
[1]    (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI:10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2.
[2]    (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System.http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization for Standardization(2022). ISO 26324:2022. Information andDocumentation – Digital Object Identifier System.https://www.iso.org/standard/81599.html
[3]    (a) Hall, S. R.;Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File (CIF): A NewStandard Archive File for Crystallography. ActaCryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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