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[单晶结构] 数据不会骗人案例11

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发表于 2025-4-15 07:05:50 | 查看全部 |阅读模式
数据不会骗人案例11
最近,某高校小伙伴求助解析一个MOF结构,笔者解析后如1所示(由Olex2[1]呈现)。
1 笔者解析好的结构(保密部分已隐去)
求助者提供的信息中没有金属NaK,不过笔者解析后发现冠醚中间有一个很大残余峰,而冠醚的上下从残余峰来看一个是水,另一个是DMF,冠醚很容易捕获金属NaK,于是笔者将其定为K,发现太大,于是改为Na,发现非常合理,差值电子密度图很干净,电荷平衡没问题,R因子也很低,于是将情况告知求助者,求助者表示合成该MOF的原料都是直接购买的,原料没有自己合成的过程,而合成MOF的过程中也从未接触过Na,如2‒3所示。
2 情况沟通
3 情况沟通
经过讨论,笔者认为很可能问题出在原料上,后来求助者找到冠醚的合成文献“Adv. Sci. 2024,11, 2308663. DOI[2]: 10.1002/advs.202308663.”,其合成步骤如4所示,其中用到了NaOH,虽然用HCl做了酸化,但从上述MOF结构解析来看,Na很可能来自原料冠醚。
4 冠醚合成步骤
然后求助者又发来一个数据,说是冠醚从另一个厂家买的,笔者解析后发现也是有Na,很显然,结构中的Na来自原料冠醚,笔者是建议将冠醚养个单晶测一下看看情况,如5所示。
5 讨论交流
由此可见,购买的药品还是要鉴定一下结构,否则做出来奇奇怪怪的结构不好解释。
视频讲解请参阅:
数据不会骗人案例11https://www.bilibili.com/video/BV1rTk5YXE6L
参考文献
[1]    Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and **ysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.
[2]    (a) International Organization forStandardization (2012). ISO 26324:2012. Informationand Documentation – Digital Object Identifier System.http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization forStandardization (2022). ISO 26324:2022. Informationand Documentation – Digital Object Identifier System.https://www.iso.org/standard/81599.html
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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