晶体测试案例24(多层堆积晶体) 最近,同单位某课题组同学委托笔者帮忙测试晶体,仅含CHO元素的无手性纯有机化合物,其样品如图1所示。 ▲图1 晶体样品 很显然,该晶体是多层晶体堆积生长的结果,不过好在底部看起来像是有一层很厚的晶体,于是将其用粉刺针将其捣碎,从碎片中扒拉寻找,得到一颗较为合适的晶体,该晶体不是多层,其上无明显裂痕,也无小晶体附着,如图2红色将头所指。 ▲图2 捣碎的晶体 用真空硅脂(7501高真空硅脂)将该晶体粘在直径与其大小相当的玻璃丝顶端,如图3所示。 ▲图3 安装好的晶体 其晶体尺寸经测量(参阅推文“布鲁克D8 VENTURE测量晶体尺寸操作步骤”或视频“APEX3 D8 Venture对心时晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1Cq4y1d7S5”“晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1hM4y1J71o”)为0.2911 × 0.3941 × 0.4244mm3,如图4‒6所示(由APEX3[1]呈现),无明显规则形状,可描述为块状(block)或无规则状(irregular)。 ▲图4 晶体尺寸测量 ▲图5 晶体尺寸测量 ▲图6 晶体尺寸测量 上机测试,钼靶1秒曝光时间测定晶胞,发现衍射点不错,决定收集完整数据,按照7秒曝光时间收集完整数据,大约耗费45分钟时间,其衍射图如图7所示(由APEX4[2]呈现),共收集到4轮384帧衍射图,总大小为384 MB。 ▲图7 衍射图 数据处理后,结构解析和精修结果如图8所示(由Olex2[3]呈现),无AB级警报。 ▲图8 解析结果 视频讲解请参阅: 晶体测试案例24(多层堆积晶体):https://www.bilibili.com/video/BV1dcPbezEwe 参考文献 [1] Bruker (2018). APEX3 (Version 2018.7-2). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA. [2] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA. [3] Dolomanov, O. V.;Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and **ysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726. 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:晶体测试案例24(多层堆积晶体).pdf
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