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[单晶XRD] 晶体测试案例147(非预期结果放弃测试)

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发表于 昨天 08:38 | 查看全部 |阅读模式
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中难免存在疏漏谬误,请不吝指正。
晶体测试案例147(非预期结果放弃测试)
>>样品准备
最近,本课题组同学委托笔者帮忙测试一个含CHNOBFSBr元素的手性有机化合物晶体(该化合物在之前推文“晶体测试案例133(黑红色晶体)”中测试结果为消旋体,因此重新培养晶体再次测试),该化合物在20毫升样品瓶中用二氯甲烷(DCM, dichloromethane, CAS: 75-09-2)和乙醚(DEE, diethyl ether, CAS: 60-29-7)作为溶剂采用气相扩散法结晶,在瓶底析出红色簇状晶体,如1所示。
1 待测晶体
用刮勺捞出部分晶体置于载玻片上用二甲基硅油(PDMS, polydimethylsiloxane/Dimethicone, CAS: 9006-65-9)包裹并在偏光显微镜下观察,如2所示(左侧为亮场,右侧为暗场),用粉刺针切割、清洗并扒拉出合适的晶体(红色箭头所指)进行测试。
2 晶体切割、清洗与挑选
>>晶体尺寸测量
测量晶体尺寸时,发现晶体呈弯曲状,晶体尺寸经测量为0.022 × 0.090 × 0.101 mm3,如3‒5所示(由APEX6[1]呈现),晶体最小尺寸不足其他尺寸的二分之一,可描述为片状(plate)晶体参阅视频“晶体尺寸和晶癖描述需保持一致:https://www.bilibili.com/video/BV1yb421B72r”。
3 晶体尺寸测量
4 晶体尺寸测量
5 晶体尺寸测量
在晶体对心时,可顺便拍摄晶体照片(参阅推文“D8 Venture衍射仪拍摄晶体照片”)保存,可作为论文插图,如6所示。
6 仪器拍摄的晶体照片
>>预实验
点击Collect下的Run Experiment,然后在右侧界面第一行选择辐射光源(钼靶),在第二行第一列下拉菜单中选择Fast Scan,设置好Fast Scan参数(曝光时间2.000秒,步长1.000°)后,点击右下角Validate验证操作有效性,完成后点击右下角Execute执行即可,如7所示。
7 设置Fast Scan实验
8所示,耗时约9分钟共收集180帧衍射图,无过曝,其衍射图如9所示,衍射较弱。
8 预实验测试情况(钼靶)
9 预实验衍射图(钼靶)
钼靶结果,可能衍射太弱,BravaisLattice难以确定,如10所示。
10 钼靶衍射结果
随即用铜靶,按5秒曝光时间收一轮Fast Scan,如11所示。
11 铜靶Fast Scan实验设置
12所示,耗时约18分钟共收集180帧衍射图,无过曝,其衍射图如9所示。
12 预实验测试情况(钼靶)
13 预实验衍射图(铜靶)
此时BravaisLattice14所示,大概率是Monoclinic C(其诊断指标FOM值为0.72)。
14 铜靶衍射结果
对其进行还原,在XPREP [2]中确定空间群,如15所示,显然是中心对称空间群,与之前结果相同,为消旋体,遂放弃测试。
15 空间群确定
参考文献
[1]    Bruker (2024). APEX6 (Version 2025.6-0). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.
[2]    Bruker (2014). XPREP (Version 2014/2), Program for Space Group Determination.Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.

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