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[审稿意见] 无AB级警报不意味着结构正确(审稿意见)

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发表于 2025-9-10 06:55:03 | 查看全部 |阅读模式
AB级警报不意味着结构正确(审稿意见)
案例来源:CCDC[1] 2354708. Chin. J. Inorg. Chem. 2024, 40, 2422‒2428. DOI[2]: 10.11862/CJIC.20240278.
审稿意见:
配合物2的结构问题:作者在正文图1给出的配合物2的结构中溶剂为DMF,但CIF[3]中溶剂是C4H7O,请更正;正文表1中的配合物2分子量使用的也是CIF中错误结构的分子量。
1所示(由Olex2[4]呈现),结构中两个溶剂分子解析的时候定成了“C4H7O”,实际上差值电子密度图表明中间的碳原子(C23)定小了,实际上应该是更大的氮原子。
1 溶剂分子原子指认错误
原子指认错误并未触发AB级警报,其验证报告如2所示,有一个C级警报PLAT244(参阅推文“CheckCIF-PLAT244”)提示C23可能存在问题。
2 结构解析错误结果的验证报告
当原子指认正确后,差值电子密度图无明显异常,如3所示。
3 原子指认正确的结果
CheckCIF/PLATON[5]系统能够检查一致性、规范性等基础问题,对于结构是否正确,还是需要人来评判,总之需要明确的是,没有AB级警报不代表结构一定正确,没有问题,反之,即便有警报也不代表结构错误,存在问题(参阅推文“CheckCIF-B级警报PLAT987(审稿意见)”)。
视频讲解请参阅:
AB级警报不意味着结构正确(审稿意见)https://www.bilibili.com/video/BV11DfdYpEnb
参考文献
[1]    (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI: 10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2.
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声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。


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