晶体结构不是预期结构案例19 案例55:CCDC 2471131. DOI:10.5517/ccdc.csd.cc2nydxy. 本来是按照如图55所示反应式,利用LuCl3(THF)3和3当量LiCH2SiMe3在正己烷中反应来合成[Lu(CH2SiMe3)3(THF)2],结果分离得到产物经单晶X射线衍射实验得到的晶体数据进行结构解析发现是三个氯桥联的离子型双核镥配合物[Li(THF)4][{(THF)Lu(CH2SiMe3)2}2(μ-Cl)3],显然是在实验操作中未能控制好LiCH2SiMe3添加速率,或者温度,导致预料之外的产物生成。
▲图55 案例55反应示意图 相关视频: 单晶结构解析练习637(数据还原-无序处理-非预期结构):https://www.bilibili.com/video/BV1btuWz9EYX 案例56:CCDC 2476125. DOI:10.5517/ccdc.csd.cc2p3m0g. 按照如图56所示反应式,利用[Ph3PCH2CH2CH2Br]Br、氢化钠和双(2-噻吩)酮合成三元环內烯作为催化底物,但在柱层析分离过程中发现有晶体产生,并且目标产物产率不高,该晶体经单晶X射线衍射实验得到的晶体数据进行结构解析发现是一个噻吩并六元环产物(CCDC2476125),分析该结构,发现应当是产生的目标产物发生了Diels-Alder反应关环,随即发生1,3-氢迁移得到,正是由于该副产物的产生导致目标产物产率降低。
▲图56 案例56反应示意图 相关视频: 单晶结构解析练习644(数据还原-副产物-无序处理):https://www.bilibili.com/video/BV1Z2t5zsEin 案例57: 本来是按照如图57所示反应式,利用醛烯和内炔在一定条件反应合成有机物产物,并对其进行单晶培养以期确定结构,一开始找笔者帮忙测试,笔者一看毛状物,无法进行单晶X射线衍射实验,遂让其回去重新培养,过了一个暑假后,拿来块状晶体,于是帮忙进行单晶X射线衍射实验,并对得到的晶体数据进行结构解析,结果发现是硫酸钠,很显然是干燥产物的干燥剂析出来了。
▲图57 案例57反应示意图 参考文献 [1] (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI: 10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2. [2] (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System. http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization forStandardization (2022). ISO 26324:2022. Informationand Documentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html[3] (a) Die Kristallstrukturen der Dysprosium-Komplexe [DyCl3(DME)2]und [DyCl2(THF)5]+[DyCl4(THF)2]–(Crystal Structures of the Dysprosium Complexes [DyCl3(DME)2]and [DyCl2(THF)5]+[DyCl4(THF)2]–).Z. Naturforsch. 1996, 51b, 531–535. DOI: 10.1515/znb-1996-0416. (b) Willey, G. R.; Meehan, P. R.; Woodman, T.J.; Drew, M. G. B. Identification of the Dysprosium(III) Chloride Solvate DyCl3(THF)3.5:Crystal Structure of The Ion Pair [trans-DyCl2(THF)5][trans-DyCl4(THF)2].Polyhedron 1997, 16, 623–627. DOI: 10.1016/0277-5387(96)00315-4. 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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