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[CheckCIF] 晶体数据名称问题导致CheckCIF报告空白

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发表于 7 天前 | 查看全部 |阅读模式
晶体数据名称问题导致CheckCIF报告空白
最近,小红书上有小伙伴留言如1所示问题,即CheckCIF报告没有具体数值,一片空白。
1 问题描述
CheckCIF报告如2所示,的确是一片空白。
2 CheckCIF报告内容
这种情况显然需要查看CIF[1]文件,才能判断问题所在,于是相互添加了微信,对方将CIF文件发过来,用记事本的方式打开该CIF文件,发现晶体数据名称(“data_”后的字符串)是一个路径(d:\data\w10\231016c\work\231016c),如3所示。
3 晶体数据名称
对方表示晶体结构是送出去解析的,不知为何晶体数据名称会是一个路径,如4所示。
4 交流讨论
于是将晶体数据名称改为CIF文件的文件名称(231016c),如5所示。
5 修改晶体数据名称
发回去后,对称重新进行CheckCIF结构验证,各项数据均正常显示了(出于保密,本文不展示具体内容),如6所示。
6 问题解决与反馈
由于该数据有B级警报,于是在对方的求助下帮忙解决了B级警报,如7所示。
7 后续
相关内容:
推文:
3.        晶体数据名称问题
视频:
1.        合并CIF文件数据名称重复问题:https://www.bilibili.com/video/BV1bK411w7jr
2.        晶体数据名称问题1:https://www.bilibili.com/video/BV1bd4y1T7Rd
3.        晶体数据名称问题2:https://www.bilibili.com/video/BV1pa411K7Hj
4.        晶体数据名称问题3:https://www.bilibili.com/video/BV1Ad4y1W7GW
5.        晶体数据名称问题4:https://www.bilibili.com/video/BV1gh4y177xz
6.        PWT打开文件问题(名称不能有空格):https://www.bilibili.com/video/BV1HC411a7cJ
7.        APEX软件处理数据文件夹名称问题:https://www.bilibili.com/video/BV1bF4m1P7Fy
8.        晶体数据审稿意见-数据名称问题:https://www.bilibili.com/video/BV1vr421g7cv
9.        数据名称不当导致申请CCDC号无法进行:https://www.bilibili.com/video/BV1ar421w7VS
10.    CIF文件名含特殊字符导致无法在线CheckCIF:https://www.bilibili.com/video/BV1yF411v7hM
11.    晶体数据名称问题导致CheckCIF报告空白:https://www.bilibili.com/video/BV1GRe6zqEpM
修改数据名称可参阅如下视频:
Olex2调用XP更改文件名:https://www.bilibili.com/video/BV1ce411x7M6
Olex2基操-更改数据名称和添加CCDC号:https://www.bilibili.com/video/BV1yi4y127fD
晶体数据名称修改——无需任何程序或软件:https://www.bilibili.com/video/BV1HW4y1T7z5
参考文献
[1]    (a)Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File(CIF): A New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。



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