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[单晶结构] 无序示例-双三氟甲基磺酰亚胺阴离子二重无序(Science)

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发表于 2025-7-19 06:44:10 | 查看全部 |阅读模式
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)
案例来源:Science 2024, 383, 81–85.
DOI10.1126/science.adk6533
去年,某高校友友求助处理一个晶体数据,并发了晶体数据和结构示意图,如1–2所示。
1 诉求和晶体数据
2 结构示意图
拿到晶体数据后,发现结构中配位和游离的双三氟甲磺酰亚胺(NTf2)以及金刚烷基团(Ad)的原子的椭球均拉长变形严重,如3所示。
3 晶体数据情况
当时询问了该化合物在论文中的缩写简称为6[NTf2],于是将数据名称由原来的full改为6[NTf2],如4所示。
4 修改名称
对结构中的NTf2Ad以及Ag–C部分做了二组分无序处理,游离溶剂做了溶剂遮掩处理,最终结果如5所示。
5 最终处理结果
其处理过程可参阅视频:
关于Up修的晶体数据在Science发表这件事:https://www.bilibili.com/video/BV1TN4y1s7a1
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.
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