相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3) 案例来源:Science 2024, 383, 81–85. DOI:10.1126/science.adk6533 去年,某高校友友求助处理一个晶体数据,并发了晶体数据和结构示意图,如图1–2所示。 ▲图1 诉求和晶体数据 ▲图2 结构示意图 拿到晶体数据后,发现结构中配位和游离的双三氟甲磺酰亚胺(NTf2)以及金刚烷基团(Ad)的原子的椭球均拉长变形严重,如图3所示。 ▲图3 晶体数据情况 当时询问了该化合物在论文中的缩写简称为6[NTf2],于是将数据名称由原来的full改为6[NTf2],如图4所示。 ▲图4 修改名称 对结构中的NTf2、Ad以及Ag–C部分做了二组分无序处理,游离溶剂做了溶剂遮掩处理,最终结果如图5所示。 ▲图5 最终处理结果 其处理过程可参阅视频: 关于Up修的晶体数据在Science发表这件事:https://www.bilibili.com/video/BV1TN4y1s7a1 参考文献 [1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. [2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:无序示例-双三氟甲基磺酰亚胺阴离子二重无序(Science).pdf
|