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[单晶结构] 无序示例-取代丁内酯二重无序

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发表于 4 天前 | 查看全部 |阅读模式
本帖最后由 DJ_Tokyo 于 2025-7-10 06:49 编辑
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)
最近处理一个数据,虽然各项指标参数均已极佳,椭球也十分正常,但结构中取代丁内酯附近有明显残余峰,如1所示,很明显该取代丁内酯存在无序。
1 丁内酯附近残余峰
根据残余峰位置,设计无序方案如2所示。
2 无序方案
即将取代丁内酯绕加粗绿色的碳碳键旋转一定角度,使第二组分原子拟合残余峰,用SAME指令限制其几何结构,SIMU指令限制其各向异性位移参数,经处理后,结果如3所示,各项指标参数进一步改善。
3 最终结果
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.
[3]Macrae, C. F., Edgington, P. R., McCabe, P., Pidcock, E., Shields, G. P.,Taylor, R., Towler, M. & van de Streek, J. (2006). J. Appl. Cryst. 39,453-457.

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