无序示例-巯基乙基二重无序

DJ_Tokyo

相关软件或概念：Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)

最近，某高校友友求助一个晶体数据处理，问题描述如图1所示。

▲图1 问题描述

拿到数据后用Olex2打开查看，很明显，这里的甲基C2和巯基S1存在颠倒的取向无序，如图2所示。

▲图2 甲基和巯基处电子云图

观察到C13的椭球也有拉长形变，因此设计其无序方案如图3所示。

▲图3 无序方案

依照无序方案对该巯基乙基做二组分取向无序处理，并用SAME指令和SIMU指令限制两个无序组分的几何结构和各向异性位移参数，其结果如图4所示，R1由8.80%降为2.67%，wR2由31.44%降为7.14%，Max Peak由3.1降为0.2，两个组分的键长也很合理。

▲图4 无序处理结果

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

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