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[单晶结构] 无序示例-硫脲基二重无序

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发表于 2025-6-23 07:03:29 | 查看全部 |阅读模式
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)
最近处理一个晶体数据,结构中有一个非常大的残余峰(MaxPeak = 12.0),该残余峰处于硫脲基附近,如1所示。
1 硫脲基附近的大残余峰
与硫脲基相连的羰基氧椭球形变极为严重,其附近电子云图如2所示。
2 硫脲基附近电子云图
根据上述信息,设计其无序方案如3所示。
3 无序方案
按照无序方案实施无序处理,未对几何结构进行任何限制,仅用一个SIMU指令对其各向异性位移参数进行限制,其结果如4所示,MaxPeak降为1.4,硫脲基附近电子云图正常,各个原子椭球也正常。
4 无序处理后的结果
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.
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