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[审稿意见] 晶体数据审稿意见-切勿随意使用EADP限制

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发表于 2025-6-18 06:55:48 | 查看全部 |阅读模式
SHELXLEADP指令(http://shelx.uni-goettingen.de/shelxl_html.php#EADP)(参阅推文“SHELXL指令之EADP”)切勿随意使用,否则可能会出现如下审稿意见:
  
审稿意见
  
大意
Particular  to 2, the EADP should rarely be used except where the atom positions are also  fixed with EXYZ. E.g. here the two tin atoms are restrained with EADP, but it  would be better to use SIMU if needed in these cases as with EAPD both  elliposids are exactly the same and "point" in the same direction  which doesn’t necessarily make chemical sense.
特别是对于2EADP应该很少使用,除非原子位置也用EXYZ固定。例如,在这里,两个锡原子被EADP限制,但如果需要,在这些情况下最好使用SIMU,因为使用EADP,两者椭圆完全相同,并且“指向”相同的方向,这不一定具有化学意义。
EADP指令通常和EXYZ指令(http://shelx.uni-goettingen.de/shelxl_html.php#EXYZ)(参阅推文“SHELXL指令之EXYZ”)一起用于共占据无序的原子,例如结构CCDC 1850710[1]Angew.Chem. Int. Ed. 2018, 57, 15359–15363. DOI: 10.1002/anie.201807180.)中SbSn的共占据无序,在Olex2中这种无序的原子表面会出现EXYZ字样的“纹身”,如1所示。
1 CCDC 1850710SbSn的共占据无序
另外,有一种情况,如2所示,三氟甲基(CF3)两个无序组分处于相反方向的氟原子可使用EADP指令进行限制(参阅推文“2.4. 位移参数的限制”——来自“使用自由变量和限制(目录+链接)”)。
2 无序三氟甲基中EADP限制的使用
通常情况尽量少用EADP指令,以免出现上述审稿意见。
相关视频
晶体数据审稿意见-切勿随意使用EADP限制:https://www.bilibili.com/video/BV1YD421j7YL
参考文献
[1](a) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a millioncrystal structures and rising. ActaCryst. 2002, B58, 380–388. (b) Allen, F. H. TheCambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures andrising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179.
[2]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

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