残余峰引起的A级警报PLAT972处理示例(Scale校正)

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残余峰引起的A级警报PLAT972处理示例(Scale校正)

文本所用软件/程序

Data collection and reduction: APEX4[1]    GUI: Olex2[2]    Structure solution: SHELXT[3]    Structure refinement: SHELXL[4]

最近，辽宁某高校求助处理一个晶体数据，结构中存在大的残余峰触发了两个A级警报PLAT972（参阅“CheckCIF-PLAT972”），如图1所示。

▲图1 A级警报PLAT972

要来了原始衍射图像文件（2轮数据，731个sfrm文件，554 MB），用APEX4处理数据，不是孪晶，也没有晶体滑动，正常还原后，仍有上述A级警报，线性吸收系数5.708，晶体尺寸没有测量，于是尝试在Scale校正中更改Mu*r值（默认为0.20），增大至4.00时，这两个警报降为B级（在Mu*r为2或3时，一个A级一个B级），如图2所示。

▲图2 B级警报PLAT972

于是继续增大Mu*r至5.00，此时这些警报降为C级，如图3所示。

▲图3 无AB级警报

参考文献

[1] Bruker (2021).  APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on Area  Detectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.    [2] Dolomanov, O.  V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,  Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.    [3] Sheldrick, G.  M. SHELXT – Integrated Space-Group  and Crystal Structure Determination. Acta  Cryst. 2015, A71, 3–8. DOI:  10.1107/S2053273314026370.    [4] (a)  Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,  University of Göttingen, Germany, 2019. (b)  Sheldrick, G. M. A Short History of SHELX.  Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. Crystal Structure  Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle,  C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors  for SHELXL – model, implementation and  application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI:  10.1107/S2053273318013840.

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