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[CheckCIF] CIF已嵌入HKL为何CheckCIF还要求FCF文件

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发表于 前天 07:40 | 查看全部 |阅读模式
CIF已嵌入HKL为何CheckCIF还要求FCF文件
在笔者微信公众号后台有小伙伴留言如1所示问题。
1 问题描述
CheckCIF上传CIF[1]文件进行验证时,出现上述界面就是要求上传结构因子文件,即FCF文件,例如Olex2[2]自带数据sucrose[3]文件如2所示,其CIF文件就是sucrose.cif,其FCF文件就是sucrose.fcf
2 sucrose的数据文件
如果CIF中没有嵌入HKL文件或者以loop循环数据形式嵌入HKL,而checkCIFSelectvalidation type又勾选了前两项中的一项时,如3红框所示,就会出现1界面。(HKL嵌入CIF可参阅推文“Olex2基操-CIF中以何种形式嵌入hkl”。)
3 Select validation type
一般来说,以SHELXL[4]程序默认形式(参阅推文“Olex2基操-CIF中以何种形式嵌入hkl”)将HKL文件(以及RES文件)嵌入CIF时,通常不会遇到1界面问题,当然,有时系统也会出故障,导致即便以SHELXL程序默认形式将HKL文件嵌入CIF也会遇到1界面问题。
当然,遇到图1界面问题时,如果希望验证结构因子,则选择文件按钮,找到对应的FCF文件,然后点击右侧的“Upload structure factor file”即可完成CIF和结构因子的验证并得到验证报告;如果只想验证CIF而不想要验证结构因子,则点击下方的“Submit for checking (without remainingstructure factors)”即可。
视频讲解请参阅:
CIF已嵌入HKL为何CheckCIF还要求FCF文件:https://www.bilibili.com/video/BV1DnDjYcESM
参考文献
[1]    (a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D.The Crystallographic Information File (CIF): A New Standard Archive File forCrystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.
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声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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