返回列表 发布新帖
查看: 27|回复: 0

[单晶结构] 无序示例-二甲基咪唑基二重无序

908

帖子

998

积分

19

金币

版主

积分
998
发表于 前天 06:55 | 查看全部 |阅读模式
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3); PLATON[3] (Version: 60124)
案例来源:CCDC2340400, DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2jkcs8.
该结构中二甲基咪唑基椭球形变严重,有三个呈三角形分布的残余峰,如1所示。
1 二甲基咪唑基椭球形变情况及其附近残余峰
观察残余峰位置,可考虑将该二甲基咪唑基做二组分无序处理,两个组分朝相反方向,用SAME指令(参阅推文“SHELXL指令之SAME”)和SIMU指令(参阅推文“SHELXL指令之SIMU”)分别对两个无序组分的几何结构和原子各向异性位移参数进行限制,结果如2所示,R因子得到极大改善,两个无序组分原子椭球也较为正常。
2 二甲基咪唑基二组分无序处理结果
视频演示请参阅:
单晶结构解析练习121(数据还原)https://www.bilibili.com/video/BV1e1421Q7yu
需要数据练习,请在以下链接下载。
1
链接:https://pan.quark.cn/s/6783b339e03f
提取码:RmZm
2
链接:https://pan.baidu.com/s/1fqoGpb_tMZAC-VjY13xwfA
提取码:5zsv
另一个类似数据如3所示。
3 二甲基咪唑基二组分无序
视频演示请参阅:
单晶结构解析练习134(孪晶拆分)https://www.bilibili.com/video/BV191421Q7Dr
需要数据练习,请在以下链接下载。
1
链接:https://pan.quark.cn/s/c6eb0f310999
提取码:wECb
2
链接:https://pan.baidu.com/s/1p3knSYLjul6-M7cwxWZlEg
提取码:mqhk
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.
[3] (a) Spek, A. L. Single-crystal structure validationwith the program PLATON. J. Appl.Cryst. 2003, 36, 7–13. (b) Spek,A. L. Structure validation in chemical crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. (c) Spek, A. L. What makes a crystal structure reportvalid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. (d) Spek, A. L. checkCIFvalidation ALERTS: what they mean and how to respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11.
如需PDF文档,请从以下链接下载:
通过网盘分享的文件:无序示例-二甲基咪唑基二重无序.pdf

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?注册

×
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

  • 微信小程序
  • 公众号
  • 微信客服

关于我们|Archiver|APP客户端|小黑屋|物质结构社区 ( 闽ICP备2024081439号-1 )

GMT+8, 2025-6-7 03:24 , Processed in 0.015240 second(s), 6 queries , Redis On.

Powered by Discuz! X5.0

© 2001-2025 Discuz! Team.

在本版发帖
科研需求联系客服
添加微信客服
返回顶部
快速回复 返回顶部 返回列表