相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3); PLATON[3] (Version: 60124) 案例来源:CCDC2340400, DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2jkcs8. 该结构中二甲基咪唑基椭球形变严重,有三个呈三角形分布的残余峰,如图1所示。 ▲图1 二甲基咪唑基椭球形变情况及其附近残余峰 观察残余峰位置,可考虑将该二甲基咪唑基做二组分无序处理,两个组分朝相反方向,用SAME指令(参阅推文“SHELXL指令之SAME”)和SIMU指令(参阅推文“SHELXL指令之SIMU”)分别对两个无序组分的几何结构和原子各向异性位移参数进行限制,结果如图2所示,R因子得到极大改善,两个无序组分原子椭球也较为正常。 ▲图2 二甲基咪唑基二组分无序处理结果 视频演示请参阅: 单晶结构解析练习121(数据还原):https://www.bilibili.com/video/BV1e1421Q7yu 需要数据练习,请在以下链接下载。 (1) 链接:https://pan.quark.cn/s/6783b339e03f 提取码:RmZm (2) 链接:https://pan.baidu.com/s/1fqoGpb_tMZAC-VjY13xwfA 提取码:5zsv 另一个类似数据如图3所示。 ▲图3 二甲基咪唑基二组分无序 视频演示请参阅: 单晶结构解析练习134(孪晶拆分):https://www.bilibili.com/video/BV191421Q7Dr 需要数据练习,请在以下链接下载。 (1) 链接:https://pan.quark.cn/s/c6eb0f310999 提取码:wECb (2) 链接:https://pan.baidu.com/s/1p3knSYLjul6-M7cwxWZlEg 提取码:mqhk 参考文献 [1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. [2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. [3] (a) Spek, A. L. Single-crystal structure validationwith the program PLATON. J. Appl.Cryst. 2003, 36, 7–13. (b) Spek,A. L. Structure validation in chemical crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. (c) Spek, A. L. What makes a crystal structure reportvalid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. (d) Spek, A. L. checkCIFvalidation ALERTS: what they mean and how to respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11. 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:无序示例-二甲基咪唑基二重无序.pdf
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