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[单晶结构] 结构解析有时候也靠运气

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发表于 3 小时前 | 查看全部 |阅读模式
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中难免存在疏漏谬误,请不吝指正。
结构解析有时候也靠运气
在进行晶体结构解析的时候,有时候会遇到同一个数据:
1、一开始解析不成功,各种尝试后莫名其妙成功了
2、某一个时间解析不成功,另一个时间解析成功的
3、某台电脑解析不成功,换台电脑解析成功的
4、已经解析成功的数据,重新解析无法解出结构
此类现象其实属于正常现象,某次在布鲁克晶体群中,有人提到这个问题,引发大量共鸣讨论,如1所示。
1 对于解析结构的讨论
结构解析,要解决的是相位问题(参阅推文“晶体学逻辑的个人见解(一)-RememberingGeorge Sheldrick”),通常程序在解析相位的时候,是随机给定一个初始值进行解析,因此,每次运行程序去进行结构解析时,初始值可能都不一样,所以每次尝试可能成功,也可能不成功,也就是解析成功与否可能存在运气成分,以上为笔者个人理解,不一定正确,仅供参考。
目前大家首选的结构解析程序大概率是SHELXT [1],不过它也不是万能的,当它解不出结果时,可以更换其他程序,以下是一些案例:
推文
视频
1.        SHELXT未找到符合空间群案例1:https://www.bilibili.com/video/BV1jH4y177B4
2.        单晶结构解析练习384(数据还原-SHELXT未找到符合空间群):https://www.bilibili.com/video/BV1c86vYrEF2
3.        SHELXT解析失败SHELXS救场案例:https://www.bilibili.com/video/BV1oqtFeREfL
参考文献
[1]    Sheldrick,G. M. SHELXT – Integrated Space-Groupand Crystal Structure Determination. ActaCryst. 2015, A71, 3–8. DOI:10.1107/S2053273314026370.

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