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[Shelx/Olex2] SHELX制表程序xcif的下载及其使用示例

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发表于 2 小时前 | 查看全部 |阅读模式
SHELX主页(https://shelx.uni-goettingen.de/)左侧一列,点击“Downloads”如1所示。
1 SHELX主页
然后点击底部的“downloadthe programs”,如2所示。
2 download the programs
进入登陆界面,输入用户名(shelx)和密码(I43212),如3所示。
3 登录界面
登录后进入程序下载列表界面如4所示。
4 程序下载列表
根据自己电脑操作系统进入相应的文件夹,如笔者为64windows操作系统,因此点击“win64/”进入程序下载列表界面,如5所示。
5 win64中程序列表
制表程序为772 KBciftab.exe,点击下载,如6所示。
6 下载好的ciftab.exe
将该程序和需要制表的CIF[1]文件放在一起,以Olex2[2]自带数据sucrose为例,如7所示。
7 CIFciftab.exe处同一文件夹内
CIF文件拖拽至ciftab.exe,如8所示。
8 ciftab.exe打开CIF文件
默认选择的是R,因为要从CIF中提取数据,所以输入T,如9所示。
9 修改数据来源
随着程序进行,出现两个问题“**Cannot found or open file ciftab.rta **”和“** Cannot open file **”,如10所示。
10 遇到的问题
结果是产生了一个1 KBfort.2文件,如11所示。
11 fort.2文件
ciftab.exe重命名为xcif.exe,如12所示。
12 ciftab.exe重命名为xcif.exe
CIF文件拖拽至xcif.exe,如13所示。
13 xcif.exe打开CIF文件
此时可正常运行,如14所示。
14 运行情况
此时生成了一个16 KBsucrose.rtf文件,如15所示。
15 sucrose.rtf文件
word打开sucrose.rtf文件,即为晶体数据报告,如16所示。
16 xcif.exe生成的晶体数据报告
xcif.exeShelxtl[3]的子程序XCIF,如17所示。
17 Shelxtl子程序XCIF
视频操作演示请参阅:
SHELX制表程序的下载及其使用示例:https://www.bilibili.com/video/BV16W421N7bA
相关推文:
参考文献
[1](a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic InformationFile (CIF): a New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. (b)Hall, S. R. The STAR File: A New Format for Electronic Data Transfer andArchiving. J. Chem. Inf. Comput. Sci.1991, 31, 326–333. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508.
[2]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[3]Bruker (2003). Shelxtl (Version 6.148/06/00). Program for Structure Solutionand Refinement. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.

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