相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); PLATON[2] (Version: 60124); SHELXL[3] (Version: SHELXL-2019/3) 前段时间,有小伙伴向笔者提出如图1所示问题。 ▲图1 问题描述 对于这一问题,笔者也不甚了解,于是咨询了相关大佬,原来是因为PLAT791(参阅推文“CheckCIF-PLAT791”)对手性碳构型的判断存在争议,所以CheckCIF/PLATON的作者Spek暂时取消了该功能,如图2所示,所以取消该功能的时间段内手性结构的CheckCIF报告都不会有PLAT791了。 ▲图2 咨询结果 以“J. Org. Chem. 2023, 88, 3802–3807. DOI:10.1021/acs.joc.2c03073.CCDC:2183778”为例,其晶体数据投稿时的checkcif报告(图3下)中有G级警报PLAT791提示结构中C3为S构型,而当前(2024.02.02)的checkcif报告(图3上)中则没有PLAT791。 ▲图3 2183778.cif的checkcif验证报告 如图4所示为2183778.cif的结构。 ▲图4 2183778.cif结构 当前(2024.02.02)最新版(Version: 60124)验证报告中也没有PLAT791,如图5所示。 ▲图5 2183778.cif的PLATON验证报告 相关视频: 手性结构CheckCIF为何没有PLAT791:https://www.bilibili.com/video/BV16v421i7Ve 参考文献 [1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. [2] (a) Spek, A. L. Single-crystal structure validationwith the program PLATON. J. Appl.Cryst. 2003, 36, 7–13. (b) Spek,A. L. Structure validation in chemical crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. (c) Spek, A. L. What makes a crystal structure reportvalid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. (d) Spek, A. L. checkCIFvalidation ALERTS: what they mean and how to respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11. [3](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/2, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:CheckCIF-G级警报PLAT791.pdf
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