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[单晶结构] 无序示例-苯甲酰基二重无序

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发表于 2025-5-11 07:18:50 | 查看全部 |阅读模式
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)
最近处理一个晶体数据,其苯甲酰基椭球有点拉长,附近有一些残余峰,如1所示。
1 椭球拉长的苯甲酰基
无序方案设计为绕羰基碳和另一个苯环碳为轴旋转的二重无序,如2所示。
2 无序方案
按无序方案对苯甲酰基做二重无序处理,相对应的键长用SADI指令限制使其等长,对无序原子用SIMU指令限制使其各向异性位移参数相似,苯环可以用AFIX 66进行刚性固定,最终结果如3所示。
3 处理最终结果
无序处理前后,参数变化如下表所示。
  
  
Max  Peak
Min  Peak
R1
wR2
处理前
0.2
-0.2
5.43%
14.12%
处理后
0.1
-0.2
5.28%
13.40%
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.
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