晶体数据还原示例45(完整度) 最近,某高校小伙伴的一个晶体数据完整度只有53.2%,如图1所示(由Olex2[1]呈现)。 ▲图1 数据情况 拿到原始衍射图像文件(5轮数据,1092帧sfrm,总大小280MB),用APEX4[2]打开查看,如图2所示,曝光时间为10秒,衍射情况很好。 ▲图2 正常情况衍射图 然而往后查看发现,第1轮数据第58‒195帧衍射图中完全没有衍射点,如图3所示。 ▲图3 没有衍射点的衍射图 没有衍射点的衍射图数量占总量的约13%(138/1092),将没有衍射点的衍射图排除在外后对该数据重新还原,最终数据完整度为91.6%,如图4所示。 ▲图4 重新处理后的数据完整度 由于大量衍射图中没有衍射点,造成数据完整度不足,有一个A级警报PLAT029(参阅推文“CheckCIF-PLAT029”)和一个B级警报PLAT911(参阅推文“CheckCIF-PLAT911”),考虑到该数据的实际情况,这个结果是完全可以理解并可以接受的,当然,如果有条件的话,可以重新培养晶体重新测试以期拿到完整度足够的数据。 ▲图5 AB级警报 参考文献 [1] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726. [2] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1).Program for Data Collection on Area Detectors. Bruker AXS Inc., Madison,Wisconsin, USA. 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。 如需PDF文档,请从以下链接下载:
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