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[单晶结构] 晶体数据还原示例45(完整度)

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发表于 2025-5-11 07:14:50 | 查看全部 |阅读模式
晶体数据还原示例45(完整度)
最近,某高校小伙伴的一个晶体数据完整度只有53.2%,如1所示(由Olex2[1]呈现)。
1 数据情况
拿到原始衍射图像文件(5轮数据,1092sfrm,总大小280MB),用APEX4[2]打开查看,如2所示,曝光时间为10秒,衍射情况很好。
2 正常情况衍射图
然而往后查看发现,第1轮数据第58‒195帧衍射图中完全没有衍射点,如3所示。
3 没有衍射点的衍射图
没有衍射点的衍射图数量占总量的约13%138/1092),将没有衍射点的衍射图排除在外后对该数据重新还原,最终数据完整度为91.6%,如4所示。
4 重新处理后的数据完整度
由于大量衍射图中没有衍射点,造成数据完整度不足,有一个A级警报PLAT029(参阅推文“CheckCIF-PLAT029”)和一个B级警报PLAT911(参阅推文“CheckCIF-PLAT911”),考虑到该数据的实际情况,这个结果是完全可以理解并可以接受的,当然,如果有条件的话,可以重新培养晶体重新测试以期拿到完整度足够的数据。
5 AB级警报
参考文献
[1]    Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726.
[2]    Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1).Program for Data Collection on Area Detectors. Bruker AXS Inc., Madison,Wisconsin, USA.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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