各向异性精修不稳定及其解决方案

DJ_Tokyo

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各向异性精修不稳定及其解决方案

如图1所示，在布鲁克晶体交流群中，有小伙伴遇到这样的问题，初始解析结构模型良好，但执行各向异性精修时，结构模型直接散架（或称**），并且所有原子都变成非正定（NPD, non-positive definite，参阅推文“原子非正定问题处理合集”）状态，张老师给出了解答，原因是从各向同性变为各向异性，参数跳跃太快，需要加个SHELXL [1]指令DAMP（参阅推文“SHELXL指令之DAMP”）使其慢慢降下来，待精修稳定后，再删除DAMP指令，该小伙伴尝试后，问题得到解决。

▲图1 问题讨论

参考文献

[1]    (a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2025/1, Program for Crystal Structure Refinement, University of Göttingen,Germany, 2019. (b)Sheldrick, G. M. A Short History of SHELX.Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. CrystalStructure Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI:10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.;Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical Scattering Factors for SHELXL – Model, Implementation andApplication. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI:10.1107/S2053273318013840.