返回列表 发布新帖
查看: 19|回复: 0

[CheckCIF] 多了TITL命令导致B级警报PLAT196

1417

帖子

1790

积分

155

金币

版主

积分
1790
发表于 昨天 08:55 | 查看全部 |阅读模式
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中难免存在疏漏谬误,请不吝指正。
多了TITL命令导致B级警报PLAT196
1所示,最近有小伙伴遇到一个问题,ins文件中有赋予温度的TEMP指令(参阅推文“SHELXL指令之TEMP”),通过笔者的建议,其CIF [1]中嵌入的res文件中也有TEMP指令记录,然而还是触发了B级警报PLAT196(参阅推文“CheckCIF-PLAT196”)。
1 问题描述
由于该小伙伴的数据还未发表,以下以3-(2,6-二异丙基苯基亚氨基)-1H-吲哚[2]CCDC [3]: 2152655)为例讲解该问题。
由于光从文字描述,难以确定问题,于是让对方把晶体数据发过来,笔者打开查看,最终发现其ins文件中第一行为内容空白的TITL指令(参阅推文“SHELXL指令之TITL”),而在底下还有一个内容与TITL之间无空格的以TITL开头的一串字符“20191118c_a.res in P2(1)/c”,如2所示。
2 ins文件中的两个TITL
在这种情况下,CIF中嵌入的res文件确实有TEMP指令,然而CheckCIF [4]显然识别的是有“20191118c_a.res in P2(1)/c”内容的TITL,该TITL之后没有TEMP,于是触发了B级警报PLAT196,如3所示。
3 重复TITL行导致B级警报PLAT196
知道了问题原因,那么解决方案也很简单,把第二条TITL整行删除,将其内容放在第一行的TITL之后(注意“TITL”和“20191118c_a.resin P2(1)/c”之间必须有一个空格,否则精修后又会恢复成原先的两行TITL结果),如此一来即可解决上述问题,如4–5所示。
4 正常ins文件中只有一个TITL命令
5 正确处理后不再有B级警报PLAT196
相关视频:
多了TITL命令导致B级警报PLAT196https://www.bilibili.com/video/BV15wwmz5EDn
参考文献
[1]    (a)Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File(CIF): A New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.
[2]    Hong, D.; Rajeshkumar, T.; Zhu, S.; Huang,Z.; Zhou, S.; Zhu, X.; Maron, L.; Wang, S. Unusual Selective Reactivity of theRare-Earth Metal Complexes Bearing a Ligand with Multiple Functionalities. Sci.China Chem. 2023, 66, 117–126. DOI: 10.1007/s11426-022-1396-x.
[3]    (a)Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million CrystalStructures and Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI:10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2.
[4]    (a) Spek, A. L. Single-CrystalStructure Validation with the Program PLATON.J. Appl. Cryst. 2003, 36, 7–13. DOI: 10.1107/S0021889802022112.(b) Spek, A. L. StructureValidation in Chemical Crystallography. ActaCryst. 2009, D65, 148–155. DOI:10.1107/S090744490804362X. (c) Spek, A. L. What Makes a Crystal Structure Report Valid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. DOI:10.1016/j.ica.2017.04.036. (d) Spek, A. L. checkCIFValidation ALERTS: What They Mean and How to Respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11. DOI: 10.1107/S2056989019016244.

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?注册

×
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

  • 微信小程序
  • 公众号
  • 微信客服

关于我们|Archiver|APP客户端|小黑屋|物质结构社区 ( 闽ICP备2024081439号-1 )

GMT+8, 2026-3-19 05:38 , Processed in 0.015674 second(s), 6 queries , Redis On.

Powered by Discuz! X5.0

© 2001-2025 Discuz! Team.

在本版发帖
科研需求联系客服
添加微信客服
返回顶部
快速回复 返回顶部 返回列表