理学晶体数据缺少par文件的一个解决方案

DJ_Tokyo

★声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中难免存在疏漏谬误，请不吝指正。

理学晶体数据缺少par文件的一个解决方案

之前有小伙伴给予笔者的一个理学晶体数据，笔者不小心误删了其par文件，导致在使用CrysAlisPro [1]重新处理数据时，才发现只有预实验的par文件（带有pre前缀的pre_nanji_5441.par）可供选择，如图1所示，该数据共有21轮衍射图，打开pre_nanji_5441.par的话，只能处理3轮数据（每轮10帧共30帧衍射图），如图2所示，从而导致数据完整度极低（4.1%），且无法解出结构，如图3所示（由Olex2[2]呈现）。

▲图1 仅存的par文件

▲图2 预实验par文件仅有3轮数据

▲图3 仅靠预实验的3轮数据无法解出结构

经笔者尝试，将pre_nanji_5441.par复制一份，进行重命名，删除其前缀，即改名为nanji_5441.par，即可正常使用进行数据处理，如图4–5所示，其结果如图6所示（该晶体由于按照正交对称性收集数据，而实际对称性为单斜，故而数据完整度只有90%）。

▲图4 可正常处理数据的par文件

▲图5 正常还原21轮数据共1296帧衍射图

▲图6 完整数据处理结果

相关视频：

单晶结构解析练习727(数据还原-非预期结构-空间群)：https://www.bilibili.com/video/BV1m5zUByEFj

如需数据进行练习，请从以下链接下载：

链接:https://pan.baidu.com/s/1Ka0ZTGznwxPn0XQLBA9ltw?pwd=pa4h

提取码: pa4h

参考文献

[1]    RigakuOxford Diffraction, (2025), CrysAlisPro Software System, version1.171.44.91a, Rigaku Corporation, Wroclaw, Poland.

[2]    Dolomanov,O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.