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[Shelx/Olex2] SHELXL输出提示-占有率

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发表于 2025-12-22 07:32:11 | 查看全部 |阅读模式
相关软件或概念:Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)
在精修的过程中,做完无序拆分,加氢后精修,Olex2背景的SHELXL输出提示氢原子的占有率与其母原子的占有率不一致,如1所示。
1 Olex2背景中的SHELXL输出提示
SHELXL发出这个提示,是因为无序的片段占有率小于1,如本例中对0.5个甲苯做了无序拆分处理,即“PART 1 20.5”和“PART 2-20.5”,而加氢后,程序将氢原子的占有率设定为1,即“PART 1 21”和“PART 2-21”,所以氢原子的占有率和氢原子的母原子的占有率不一致,如2所示。
2 氢原子及其母原子占有率不一致
对于这种情况,只需要更正氢原子的占有率即可,如3所示。
3 更正后的占有率
参考文献
[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.
[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/2, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

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