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Olex2和APEX中运行SHELXT结果形式 案例来源:CCDC[1] 2268944. Inorg. Chem. 2024, 63, 8155‒8162. DOI[2]:10.1021/acs.inorgchem.4c00367. 当SHELXT[3]程序解析结构存在多个解析结果时,在Olex2[4]中运行SHELXT的结果如图1所示,Olex2主界面显示SHELXT输出结果,共有5个结果(文件名后abcde区分),在Solve中n Space列表中可以选择一个结果进行后续解析,如果所选结果不对,则需要重新运行SHELXT,然后再选择其他结果进行后续解析。
▲图1 Olex2中运行SHELXT结果 文件夹中不会有多个文件结果,如图2所示。
▲图2 Olex2中运行SHELXT结果文件 不过,在olex2文件夹里面的临时文件夹temp中的确产生了5组带有abcde后缀的hkl和res文件,如图3所示。
▲图3 temp文件夹中的5组hkl和res文件 只不过在如图1所示界面选择其中一个结果进行后续精修后,temp文件夹中带有abcde后缀的hkl和res文件会被Olex2删除,也就是除了被选择之外的结果文件均被删除。 而在APEX(此处为APEX4[5])中运行SHELXT进行结构解析,其结果如图4所示,在左下角红框下拉列表中可以选择显示5个结果中的某个。
▲图4 APEX4中运行SHELXT结果 APEX中运行SHELXT得到的解析结果以英文字母为后缀为每个结果产生一个res和hkl文件,如图5所示,在后续解析过程中随时可以选择其中某个结果进行后续解析,如果所选结果不对,可以立即更换另外的结果而无需重新运行SHELXT进行解析。
▲图5 APX4中运行SHELXT结果文件 APEX生成的5组hkl和res文件不会被删除,可以随时选择其中一组进行后续解析和精修。 视频操作演示请参阅: Olex2和APEX中运行SHELXT结果形式:https://www.bilibili.com/video/BV1sCybYGEoC 如需数据进行练习,请从以下链接下载: 提取码: ubfy 参考文献 [1] (a) Allen, F. H. The Cambridge StructuralDatabase: a quarter of a million crystal structures and rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI: 10.1107/S0108768102003890. (b) Allen, F. H. TheCambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures andrising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. [2] (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System. http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization forStandardization (2022). ISO 26324:2022. Informationand Documentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html[3] Sheldrick, G. M. SHELXT – Integrated Space-Group and Crystal StructureDetermination. Acta Cryst. 2015, A71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053273314026370. [4] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726. [5] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1).Program for Data Collection on Area Detectors. Bruker AXS Inc., Madison,Wisconsin, USA. 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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