CIF信息完善-衍射仪探测器信息

DJ_Tokyo

CIF信息完善-衍射仪探测器信息

在之前的推文“晶体数据审稿意见-衍射仪设备信息描述”中有审稿人提到衍射仪探测器描述问题，本文介绍一下如何查看（布鲁克）衍射仪探测器信息。

笔者所在单位有两台布鲁克单晶仪，一台是布鲁克D8 Venture单晶衍射仪，其相关参数如图1所示。

▲图1 D8 Venture衍射仪信息

上图表明该仪器配备的是CMOS（Complementary Metal-Oxide-Semiconductor，互补金属氧化物半导体）探测器。

另一台是布鲁克SMARTAPEX II单晶衍射仪，其相关参数如图2所示。

▲图2 SMART APEX II衍射仪信息

从上图可知该仪器配备的是SMARTAPEX II探测器。

以上是从衍射仪设备介绍信息中获取探测器以及其他有关衍射仪的相关信息。

此外，可以直接查看探测器上的信息，如图3所示为D8 Venture的探测器（使用过程中损坏后更换的信探测器），从图中可知为PHOTON系列探测器。

▲图3 D8 Venture的探测器

如图4所示为《BrukerAXS.Server.BIS》手册中PHOTON系列探测器及相关参数。

▲图4 PHOTON系列探测器

如图5所示为SMART APEX II单晶衍射仪的探测器，可知为APEX II探测器。

▲图5 SMART APEX II的探测器

除了从上述设备实体上获取探测器的信息外，也可以在APEX软件中查看具体数据的探测器。

以APEX4[1]为例，打开衍射图文件后，在Evaluate>>Determine Unit Cell界面，衍射图下方Image Header项中有一个Detector，如图6所示。

▲图6 Evaluate>>DetermineUnit Cell>>Image Header>>Detector

将其展开后如图7所示，测试该数据的衍射仪其探测器为PHOTON-100（CMOS-PHOTON100）。

▲图7 某数据探测器信息

后来探测器损坏，更换的新探测器如图8所示，为PHOTON-II（CMOS-PHOTONII）。

▲图8 某数据探测器信息

如图9所示为某数据探测器信息，可知其探测器为PHOTON-III，更具体地为CMOS-PHOTONIII-C7。

▲图9 某数据探测器信息

如图10所示为SMART APEX II单晶衍射仪的探测器APEX2（CCD-LDI-APEX2）。

▲图10 某数据探测器信息

CIF[2]中有关探测器信息的条目通常有“_diffrn_detector”“_diffrn_detector_area_resol_mean”和“_diffrn_detector_type”（参阅推文“CIF核磁词典-DIFFRN_DETECTOR”），分别记录探测器的一般类别（general class）、区域探测器的分辨率（resolution，单位为pixels·mm−1）和品牌（make）、型号（type）或名称（name）。

于是，对于上面图7‒10四个数据，CIF中这三条项目可填入内容如下：

_diffrn_detector                                      'Bruker PHOTON-100 areadetector'

_diffrn_detector_area_resol_mean         10.4

_diffrn_detector_type                             'CMOS-PHOTON100 area detector'

_diffrn_detector                                      'Bruker PHOTON-II area detector'

_diffrn_detector_area_resol_mean         7.4

_diffrn_detector_type                             'CMOS-PHOTONII area detector'

_diffrn_detector                                      'Bruker PHOTON-III areadetector'

_diffrn_detector_area_resol_mean         7.4

_diffrn_detector_type                             'CMOS-PHOTONIII-C7 area detector'

_diffrn_detector                                      'Bruker APEX2 area detector'

_diffrn_detector_area_resol_mean         8.3

_diffrn_detector_type                             'CCD-LDI-APEX2 area detector'

视频讲解请参阅：

CIF信息完善-衍射仪探测器信息：https://www.bilibili.com/video/BV19cU8YeEzU

参考文献

[1]    Bruker(2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.

[2]   (a)Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File(CIF): A New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.

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