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[审稿意见] 元素分析与晶体结构之间的关系(审稿意见)

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发表于 2025-9-15 07:00:16 | 查看全部 |阅读模式
元素分析与晶体结构之间的关系(审稿意见)
案例来源:CCDC[1] 2354708. Chin. J. Inorg. Chem. 2024, 40, 2422‒2428. DOI[2]: 10.11862/CJIC.20240278.
审稿意见:
4页给出的配合物2的元素分析:“Anal. Calcd for C42H34NiN4O2:C, 73.60; H, 5.00; N, 8.17: Found: C, 73.91; H, 5.34; N, 8.48.”,也即没有溶剂。在做元素分析时,样品是如何处理的?
1所示(由Olex2[3]呈现),结构中包含2DMFCIF[4]中总分子式为“C48H48NiN6O4”(C, 69.32; H, 5.82; N, 10.11.),而元素分析表征则是以不含DMF的主体结构分子式“C42H34NiN4O2”为准,从而使审稿人提出了上述审稿意见。
1 CCDC 2354708结构
对于这个问题,回复是用于元素分析的样品是在加热状态下用油泵抽处理的,如2所示。
2 审稿意见回复
当用于元素分析的样品和用于单晶X射线衍射实验的样品是同一批时,元素分析的分子式和晶体结构的分子式应当保持一致,而其他情况下,不一致是正常的。
举例来说,如3所示,比如反应物AB在溶剂C(假定单一溶剂)中以某种条件合成产物D,首先得到粗品D,然后经纯化(纯化过程可能引入溶剂或其他杂质)得到纯品D,得到的纯品D可以分出几部分用于各种表征如核磁、元素分析、红外、熔点等,如果需要测单晶,而纯品D又不是晶体,则需要首先将其培养成晶体,例如使用溶剂E(假定单一溶剂培养晶体)对其进行单晶培养,如果溶剂E结晶在晶体结构中,那么测单晶的晶体D样品成分和纯品D样品成分就会不同。
3 合成到测试过程示意图
综上,对一个新化合物做表征分析时,分析结果要和具体样品对应,最重要是要(及时)做好实验记录,如此方能从容应对审稿意见、论文答辩等各种质疑。
视频讲解请参阅:
元素分析与晶体结构之间的关系(审稿意见)https://www.bilibili.com/video/BV1bef7YSEM7
参考文献
[1]    (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI:10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2.
[2]    (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System.http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization for Standardization(2022). ISO 26324:2022. Information andDocumentation – Digital Object Identifier System.https://www.iso.org/standard/81599.html
[3]    Dolomanov, O. V.;Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.
[4]    (a) Hall, S. R.;Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File (CIF): A NewStandard Archive File for Crystallography. ActaCryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。



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