Olex2中运行XPREP提示Cannot open reflection data file

DJ_Tokyo

Olex2中运行XPREP提示Cannot open reflection data file

文本所用软件/程序

Data collection and reduction: APEX4[1]    GUI: Olex2[2]    Space group determination: XPREP[3]

最近，浙江某高校友友在Olex2中运行XPREP时提示“Cannot openreflection data file”，如图1所示。

▲图1 问题描述

对方将数据发来后，笔者一看，是布鲁克单晶仪测试得到的数据，并且做了孪晶拆分，因此p4p文件和hkl文件的名称不一致，如图2所示，p4p文件的名称是“231219b_0m”，而hkl文件的名称则是“231219b_0m_4”和“231219b_0m_5”，当用Olex2打开p4p文件并运行XPREP时，XPREP找不到与p4p同名的hkl文件，于是就出现了“Cannot openreflection data file”提示。

▲图2 数据文件

遇到这种情况，解决方案很简单，对数据文件进行重命名即可。

可以复制一份p4p文件，分别重命名为“231219b_0m_4”和“231219b_0m_5”，如图3所示。

▲图3 重命名的文件

此时在Olex2中打开p4p文件并运行XPREP时，XPREP可以读取对应hkl文件，如图4‒5所示。

▲图4 XPREP正常读取hkl文件

▲图5 XPREP正常读取hkl文件

还有一种解决方案，就是孪晶拆分后，在APEX软件中运行XPREP，可以分别选择p4p文件和hkl文件，不需要两者同名，如图6所示。

▲图6 APEX中运行XPREP时选择p4p文件和hkl文件

视频演示操作请参阅：

Olex2中运行XPREP提示Cannot openreflection data file：https://www.bilibili.com/video/BV1foHEeAEkH

参考文献

[1] Bruker (2021).  APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on Area  Detectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.    [2] Dolomanov, O.  V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,  Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.    [3] Bruker (2014).  XPREP (Version 2014/2), Program for Space Group Determination.  Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.

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