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[CrysAlisPro/APEX] 晶体数据还原示例59(孪晶拆分-降低Rint)

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发表于 12 小时前 | 查看全部 |阅读模式
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中难免存在疏漏谬误,请不吝指正。
晶体数据还原示例59(孪晶拆分-降低Rint)
最近,某高校某课题组学生有一个晶体数据,Rint值较高,于是找笔者帮忙看看,如1–2所示(1Olex2 [1]呈现)。
1 求助情况
2 数据情况
笔者拿到数据后,解压,该数据总共6轮数据,485帧衍射图,总大小750 MB,其衍射图如图3所示(由APEX6 [2]呈现)。
3 衍射图
按默认设置收集衍射点(HarvestSpots),进行指标化(Index),如4所示,三个方法均能给出正确晶胞,但指标化率不太理想。
4 指标化情况
查看倒易空间点阵(ReciprocalLattice),如5–7所示,可能存在孪晶问题。
5 倒易空间点阵A轴方向
6 倒易空间点阵B轴方向
7 倒易空间点阵C轴方向
于是按照推文“APEX4孪晶拆分步骤(Domains)”所述方法对其进行孪晶拆分处理,结果如8所示,Rint以及R1wR2均大幅降低,无AB级警报。
8 孪晶拆分处理结果
参考文献
[1]    Dolomanov,O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.
[2]    Bruker(2024). APEX6 (Version 2025.6-0). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.

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