晶体数据审稿意见-报道真实键

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晶体数据审稿意见-报道真实键

文本所用软件/程序

GUI: Olex2[1]    Structure refinement: SHELXL[2]

案例来源：New J. Chem. 2024, DOI[3]:10.1039/d4nj02131b. CCDC[4]: 2353121.

审稿意见

大意

Q: Some structures report spurious bonds, such as Distance (Yb1-C14): 2.990. Please make sure that only real bonds will appear in the CIF bond table.    A: This is a kind of π-M bond as η-mode. Similar distances can be found in the literatures (J. Organomet. Chem. 1992, 429, 27-39; Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 12678-12683. Dalton  Trans. 2014, 43,  2521-2533; Chem. Eur. J. 2020,  26, 16098-16110).

问：某些结构报道了可疑的键，例如距离（Yb1-C14）：2.990。请确保仅有真实键出现在CIF键表中。       答：这是一种η模式的π-M键。相似的距离可见于一些文献（J.  Organomet. Chem. 1992,  429, 27-39; Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 12678-12683. Dalton  Trans. 2014, 43,  2521-2533; Chem. Eur. J. 2020,  26, 16098-16110）。

审稿人认为如图1所示的Yb1‒C14键键长太长，不是真实键，因此希望将删除。

▲图1 审稿人指的键

不过，作者认为这里是种η模式的π-M键（C2=C14→Yb1），如图2所示，因此并未将其删除，并给出了一些文献作为支持。

▲图2 具体结构

相关视频：

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参考文献

[1] Dolomanov, O.  V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,  Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.    [2] (a)  Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,  University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick,  G. M. A Short History of SHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. Crystal Structure  Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle,  C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors  for SHELXL – model, implementation and  application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI:  10.1107/S2053273318013840.    [3] (a) International Organization for Standardization  (2012). ISO 26324:2012. Information and  Documentation – Digital Object Identifier System. http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506.  (b) International Organization for Standardization (2022). ISO 26324:2022. Information and Documentation – Digital  Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html    [4] (a) Allen, F.  H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal  structures and rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:  10.1107/S0108768102003890.  (b) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million  crystal structures and rising. Acta  Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:  10.1107/S2052520616003954.

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