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[单晶结构] 关于申请CCDC号的一点信息

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发表于 2025-4-21 10:26:52 | 查看全部 |阅读模式
关于申请CCDC号的一点信息
在浏览器中输入剑桥晶体数据中心(CambridgeCrystallographic Data Centre, CCDC)官网网址:https://www.ccdc.cam.ac.uk/
进入网页后,点击网页右上角附近的Sign in按钮进入登陆页面,如下图红色方框所示:
在跳转后的页面Usernameor Email输入用户名或电子邮件,在Password输入密码,然后点击Sign in按钮登录,如下如红色方框和红色箭头所示:
在跳转后的页面右上角,账户栏下拉菜单中点击My Structures,如下图红色方框所示:
My Structures页面有一个表格,这个表格中列出了通过此账号申请的所有CCDC号及对应晶体数据的信息,如下图所示:
标题中DepositionNumber(存储号)一列就是晶体数据的CCDC号,例如上表中的21526562152655
标题中Datablock(数据块)一列是晶体数据的数据标题,它是未添加任何其它信息的晶体信息文件(CrystallographicInformation File, CIF)中的第一行的内容,例如上表中的data_s2,是该晶体数据CIF文件的第一行内容,如下图红色方框所示:
其中s2是不带扩展名的CIF文件名名称,如下图所示:
通常CIF的文件名就是"data_"后的内容,除非对该CIF文件进行了重命名,但代表数据的名称以CIF文件内的data_s2(本例为s2)为准,而不是以CIF文件的文件名为准。
标题中的DepositionOn是指数据存储日期,也就是申请CCDC号的日期,例如上表中的16/02/2022,表示这个数据是2022216日提交的CCDC号申请日期。
标题中的DepositedBy是指存储数据的作者,此处显示的是作者的邮箱。
标题中的Refcode是参考码(reference code),例如下图中已经发表的CCDC号为1574065的数据其RefcodeHIXTOA
标题中的Formula是该数据化合物的分子式,它是CIF问中_chemical_formula_moiety条目的内容,例如上表中的C23 H27 Cl N2CIF中如下图所示(单引号内的内容)
若带有抗衡离子、溶剂等,即,不对称单元中存在多个独立片段,则每个片段之间以逗号隔开,例如CCDC号为2152654的结构,下图所示:
该数据CIF文件中_chemical_formula_moiety条目的内容如下图所示:
标题中EmbargoedDate(禁运日期)是申请了CCDC号,但还未发表的数据的保密期起始日期,如果是刚申请的CCDC号,则该日期与申请日期相同。该日期后面有一个问号,将鼠标光标悬停在上面,会有一个信息框弹出,如下图所示:
该框内容如下:
Datawill be embargoed (put on hold) for a year from the point of deposition. Duringthis period the data is not disclosed to the public unless it is publishedthrough a scientific article or directly through a database. At any point thedepositor can choose to make the data public through the CSD (as a CSDCommunication) or the ICSD (as an ICSD Communication) or to extend the embargoperiod for another year. We will contact the depositor if data has not beenpublished within the embargo period. If neither you, nor any co-authorsinstruct us otherwise and you do not respond to requests for furtherinstructions then these structures may be published directly through the CSD orthe ICSD after the embargo period.
大意如下:
数据自存储日起将被禁运(暂停)一年。在此期间,除非通过科学文章或直接通过数据库发表,否则数据不会向公众披露。在任何时候,储户均可选择通过CSD(作为CSD通讯)ICSD(作为ICSD通讯)公开数据,或者将禁运期再延长一年。若数据未在禁运期内发表,我们将联系储户。若您或任何合著作均未另行指示,且您未回复进一步指示的请求,则这些结构可能在禁运期后通过CSDICSD直接发布。
剑桥结构数据库,CambridgeStructural Database, CSD
无机晶体结构数据库,InorganicCrystal Structural DatabaseICSD
标题最后一列Status表示数据的当前状态,未发表的数据显示为Unpublished。已发表的数据,会显示其发表状态,例如Publishedin the CSDPublishedin the ICSD,如下图所示:
点击数据第二列的Details,数据相关信息显示如下,该数据(CCDC: 1871872,公开在CSD)公开的数据库信息以及该数据所在文章信息如下图所示:
另一个数据(CCDC:1574065,公开在ICSD) 公开的数据库信息以及该数据所在文章信息如下图所示:

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