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[Shelx/Olex2] Olex2和APEX中运行SHELXT结果形式

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发表于 2025-12-9 07:17:46 | 查看全部 |阅读模式
Olex2APEX中运行SHELXT结果形式
案例来源:CCDC[1] 2268944. Inorg. Chem. 2024, 63, 8155‒8162. DOI[2]:10.1021/acs.inorgchem.4c00367.
SHELXT[3]程序解析结构存在多个解析结果时,在Olex2[4]中运行SHELXT的结果如1所示,Olex2主界面显示SHELXT输出结果,共有5个结果(文件名后abcde区分),在Solven Space列表中可以选择一个结果进行后续解析,如果所选结果不对,则需要重新运行SHELXT,然后再选择其他结果进行后续解析。
                              
1 Olex2中运行SHELXT结果
文件夹中不会有多个文件结果,如2所示。
2 Olex2中运行SHELXT结果文件
不过,在olex2文件夹里面的临时文件夹temp中的确产生了5组带有abcde后缀的hklres文件,如3所示。
3 temp文件夹中的5hklres文件
只不过在如图1所示界面选择其中一个结果进行后续精修后,temp文件夹中带有abcde后缀的hklres文件会被Olex2删除,也就是除了被选择之外的结果文件均被删除。
而在APEX(此处为APEX4[5])中运行SHELXT进行结构解析,其结果如4所示,在左下角红框下拉列表中可以选择显示5个结果中的某个。
4 APEX4中运行SHELXT结果
APEX中运行SHELXT得到的解析结果以英文字母为后缀为每个结果产生一个reshkl文件,如5所示,在后续解析过程中随时可以选择其中某个结果进行后续解析,如果所选结果不对,可以立即更换另外的结果而无需重新运行SHELXT进行解析。
5 APX4中运行SHELXT结果文件
APEX生成的5hklres文件不会被删除,可以随时选择其中一组进行后续解析和精修。
视频操作演示请参阅:
Olex2APEX中运行SHELXT结果形式:https://www.bilibili.com/video/BV1sCybYGEoC
如需数据进行练习,请从以下链接下载:
提取码: ubfy
参考文献
[1]    (a) Allen, F. H. The Cambridge StructuralDatabase: a quarter of a million crystal structures and rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI: 10.1107/S0108768102003890. (b) Allen, F. H. TheCambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures andrising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954.
[2]    (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System.http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization forStandardization (2022). ISO 26324:2022. Informationand Documentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html
[3]    Sheldrick, G. M. SHELXT – Integrated Space-Group and Crystal StructureDetermination. Acta Cryst. 2015, A71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053273314026370.
[4]    Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726.
[5]    Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1).Program for Data Collection on Area Detectors. Bruker AXS Inc., Madison,Wisconsin, USA.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。


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