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[生物医药] “无序”中的秩序:tau蛋白天然结构首次被解析

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发表于 2025-10-31 08:06:40 | 查看全部 |阅读模式
本帖最后由 搁浅 于 2025-10-31 08:07 编辑

“无序”中的秩序:tau蛋白天然结构首次被解析( DOI: 10.1016/j.str.2019.09.003

在阿尔茨海默病等神经退行性疾病的病理特征中,tau蛋白的异常聚集形成神经纤维缠结是关键标志之一。然而,尽管其聚集态结构已被冷冻电镜解析,天然状态下tau蛋白在溶液中到底长什么样却始终成谜。2019年11月,来自北卡罗来纳大学、宾州州立大学及加拿大麦吉尔大学的研究团队在《Structure》上发表研究,首次以实验-计算联用策略,解析了全长tau蛋白在溶液中的构象集合,揭示这一“经典无序蛋白”实则拥有紧凑的球状拓扑与可识别的亚结构域,并预置了易于聚集的β-片“种子”。

1. 技术突破:CL-DMD让“无序”可见

传统结构生物学手段(X射线晶体学、常规NMR)对高度柔性的内在无序蛋白(IDP)束手无策。作者采用他们新近开发的**短程交联约束导向离散分子动力学(CL-DMD)流程:
  • 在溶液中用多种交联剂(SDA、DSG、DSA)“冻结”tau的瞬时构象;
  • LC-MS/MS鉴定出数百个<7 Å的残基对距离;
  • 将这些实验距离作为能量惩罚项嵌入DMD模拟,迫使体系在纳秒-微秒尺度快速收敛;
  • 最终获得满足最多约束的最低能量构象集合。

2. 主要发现:tau不是“完全展开”的链

① 整体拓扑
  • 441个残基的2N4R tau呈紧凑球状,回转半径≈3.2 nm,远小于完全无规链;
  • 可清晰划分出四个亚结构域,呈四面体排布;N-端与C-端并未如先前模型所述相互接触,而是被中间区域隔开。
② 二级结构
  • 预测β-含量≈31%,与圆二色光谱实验(21%)高度一致;
  • R1-R4重复区(尤其是R2、R3、R4肽段)已存在瞬态β-股,其中7条β-股中的6条与纤维态核心完全对应,提示天然状态已“预置”聚集种子。
③ 实验验证
  • 155个表面可及性(SM)位点中,仅8个与模型不符;
  • 52条长程交联(11 Å)全部落在预测结构容许距离内;
  • 去除约束后的54 ns常规MD显示,拓扑骨架偏差<3 Å,证明CL-DMD未人为过度压缩。

3. 病理启示:从“ molten globule”到纤维
  • tau的溶液态被描述为能量漏斗宽阔的“熔融球”:多种构象快速互变,但共享同一拓扑;
  • 磷酸化或突变可削弱亚域间相互作用,使预置的β-股“发夹”被拉出,通过341-357区段的翻折完成分子内→分子间氢键转换,启动交叉β-片层延伸;
  • 该机制与α-突触**白的“局部结构模板”聚集模型高度相似,为**“构象选择”而非“诱导折叠”**提供了新证据。

4. 方法与资源开放
  • 所有交联质谱数据已上传PRIDE(PXD015044);
  • 代表性构象集合已提交PDB-Dev(PDBDEV_00000033);
  • CL-DMD软件可向作者团队申请获取,为其他IDP研究提供即插即用平台。

5. 结语:无序蛋白的“结构”时代

这项研究不仅首次给出了全长tau在原子层面的“照片”,更确立了实验-CL-DMD联用作为IDP结构解析的通用范式。当“无序”不再意味着“不可知”,我们就能在疾病爆发前,看清那颗即将引爆的构象种子,为早期诊断与精准药物设计铺平道路。



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