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★声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中难免存在疏漏谬误，请不吝指正。 Rint降低-舍弃部分衍射图 ▲图1 求助数据 查看其ins文件，如图2所示，HKLF指令后面有晶胞变换矩阵，显然该数据按照低对称性（可能是Triclinic P）还原和解析，然后经由PLATON [2]升空间群得到四方晶系第142号空间群I41/acd结果。 ▲图2 晶胞变换矩阵 这种情况显然需要在还原阶段进行处理，于是建议其重新还原，然后对方将原始衍射照片文件（429 MB，压缩后310.9 MB）发过来了，如图3所示。 ▲图3 建议和数据 拿到数据后，发现其衍射照片组成如下：第一轮（Run 1）共360帧衍射图，第二轮（Run 2）共22帧衍射图，还有测定晶胞的fastscan共180帧衍射图，数据收集策略中没有fastscan。 ★第1次重新还原★ 在APEX4 [3]中定完晶胞后，Bravais Lattice按照Tetragonal I进行还原，将所有数据均包含进来，如图4所示，默认设置（| I-<I> |/su ratio for rejection = 3.0）下，第1轮数据Rint = 17.88%，第2轮数据Rint = 36.84%，第3轮数据（fastscan）Rint = 31.31%。 ▲图4 各轮数据Rint值 结果如图5所示，Rint = 22.71%，还是太高。 ▲图5 第一次还原结果 尝试降低|I-<I> |/su ratio for rejection值，发现后两轮数据Rint反而升高了，如图6–7所示。 ▲图6 不同| I-<I> |/su ratio forrejection = 2时各轮数据Rint值 ▲图7 不同| I-<I> |/su ratio forrejection = 1时各轮数据Rint值 ★第2次重新还原★ 经过上面第一次重新还原，直到了大概情况，于是进行第二次重新还原，这次仅还原第1轮数据，结果如图8–9所示，最终Rint = 17.01%，小于18%，数据完整度为99.5%，与最初求助时的99.9%相比略有降低，但影响不大，最终结构解析和精修结果无AB级警报。 ▲图8 仅还原第1轮数据默认设置Scale结果 ▲图9 仅还原第1轮数据最终结构解析和精修结果 本文案例数据重新还原其实采取了两个措施，其一为按正确对称性进行数据还原，其二为标题所示舍弃部分衍射图（前提是对数据完整度影响不大，如果影响大到足以触发AB级警报，那可能需要重新培养晶体重新测试了）。 参考文献 [1] Dolomanov,O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726. [2] (a) Spek, A. L. Single-CrystalStructure Validation with the Program PLATON.J. Appl. Cryst. 2003, 36, 7–13. DOI: 10.1107/S0021889802022112.(b) Spek, A. L. StructureValidation in Chemical Crystallography. ActaCryst. 2009, D65, 148–155. DOI:10.1107/S090744490804362X. (c) Spek, A. L. What Makes a Crystal Structure Report Valid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. DOI:10.1016/j.ica.2017.04.036. (d) Spek, A. L. checkCIFValidation ALERTS: What They Mean and How to Respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11. DOI: 10.1107/S2056989019016244. [3] Bruker(2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.
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