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GIGO-选点定晶胞 GIGO：Garbage in, garbage out——错进错出，或“垃进圾出”（输入垃圾，输出垃圾）。 案例来源：CCDC[1] 2406432. Org.Lett. 2025, 27, 2741–2746. DOI[2]: 10.1021/acs.orglett.5c00518. 案例结构如图1所示（晶体结构由Olex2[3]呈现，平面结构由ChemBioDraw[4]绘制）。 ▲图1 案例结构 对于Harvest（收集衍射点）来说，APEX4[5]的默认输入（设置）为“Number of Runs = 3，Images per Run = 20，Min. I/sigma(I) = 10.00，勾选Smooth images”，如图2所示。 ▲图2 APEX4的Harvest默认设置 按上述Harvest默认输入，得到的输出为“78 reflections”，如图3所示。 ▲图3 APEX4的Harvest默认设置得到的输出 对于Index（指标化）来说，APEX4中的默认输入（设置）为“Min. I/sigma(I) = 10.00，衍射点筛选勾选Reflections must be isolated，方法（Methods）勾选Difference Vectors和Fast Fourier Transform”，如图4所示。 ▲图4 APEX4的Index默认设置 作为对比，将方法中的LeastSquares也勾上，得到的输出如图5所示，前两个方法失败（failed），第三个方法能得到一个晶胞参数，但指标化率很低。 ▲图5 默认设置得到的指标化结果 将上述指标化结果作为输入进行BravaisLattice，输出如图6所示，显然不对。 ▲图6 默认设置得到的Bravais Lattice结果 该晶体测试用的铜靶作为辐射光源，曝光时间为10秒，不过衍射较弱，如图7所示为第1、4和9轮数据的第一帧衍射照片。 ▲图7 衍射图 该数据总共10轮，所以将Harvest的输入修改为“Number of Runs = 10，Images per Run = 20，Min. I/sigma(I) = 10.00，勾选Smooth images”，如图8所示。 ▲图8 修改Harvest设置 此时得到的输出为“728reflections”，如图9所示。 ▲图9 修改Harvest设置后得到的输出结果 Index按照默认设置，728个衍射点作为输入，得到的输出为：三个方法得到相同晶胞参数，指标化率中等，得到的晶胞参数作为输入，得到的Bravais Lattice输出为正确的Monoclinic C，如图10所示。 ▲图10 输入与输出结果1 如果将Index中的“Reflections must span images”和“Reflections must be whole”也都勾上，则剩下124个衍射点，如图11所示。 ▲图11 修改Index设置 这124个衍射点作为输入，得到的Index输出结果如图12所示，指标化率良好。 ▲图12 良好的指标化率 将该指标化率结果作为输入，得到的BravaisLattice输出如图13所示。 ▲图13 修改Index设置后的结果 视频讲解请参阅： GIGO-选点定晶胞：https://www.bilibili.com/video/BV1VW7RzTEbv 视频操作： 单晶结构解析练习577(文献案例-数据还原-Rint-无序处理)：https://www.bilibili.com/video/BV1y6VTzLE9i 数据下载： 提取码: ccrc 参考文献 [1] (a) Allen, F. H.The Cambridge Structural Database: A Quarter of a Million Crystal Structuresand Rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI:10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.; Bruno, I. J.; Lightfoot, M.P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI:10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.; Robertson, J. H.; Raithby,P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Comprehensive Coordination Chemistry III 2021, 413–437. DOI:10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2. [2] (a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System. http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) McDonald J. D.;Levine-Clark, M. Encyclopedia of Libraryand Information Sciences. Fourth Edition, CRC Press, 2017. DOI: 10.1081/e-elis4. (c) Liu, J. Digital ObjectIdentifier (DOI) and DOI Services: An Overview. Libri 2021, 71, 349‒360. DOI:10.1515/libri-2020-0018. (d) International Organization for Standardization(2022). ISO 26324:2022. Information andDocumentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html[3] Dolomanov, O. V.;Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726. [4] (a) Klein, F. M.CS ChemDraw Pro,1 Version 3.1 for Windows. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1995, 35, 166–167. DOI: 10.1021/ci00023a026. (b)Cousins, K. R. ChemDraw 6.0 Ultra CambridgeSoft Corporation, 100 Cambridge ParkDrive, Cambridge, MA 02140. http://www.camsoft.com. Commercial Price: $1395.Academic Price: $699. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10257–10258. DOI: 10.1021/ja0047572.(c) Buntrock, R. E. ChemOffice Ultra 7.0. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2002, 42, 1505–1506. DOI: 10.1021/ci025575p. (d) Li, Z.; Wan, H.; Shi, Y.;Ouyang, P. Personal Experience with Four Kinds of Chemical Structure DrawingSoftware: Review on ChemDraw, ChemWindow, ISIS/Draw, and ChemSketch. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 1886–1890. DOI: 10.1021/ci049794h.(e) Mendelsohn, L. D. ChemDraw8 Ultra, Windows and Macintosh Versions. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2225–2226. DOI: 10.1021/ci040123t. (f) Cousins, K. R. ChemDrawUltra 9.0. CambridgeSoft, 100 CambridgePark Drive, Cambridge, MA 02140. www.cambridgesoft.com. See Web site for pricing options. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4115–4116. DOI:10.1021/ja0410237. (g) Zielesny, A. Chemistry Software PackageChemOffice Ultra 2005. J. Chem. Inf.Model. 2005, 45, 1474–1477. DOI:10.1021/ci050273j. (h) Mills, N. ChemDraw Ultra 10.0 CambridgeSoft, 100CambridgePark Drive, Cambridge, MA 02140. www.cambridgesoft.com. CommercialPrice: $1910 for download, $2150 for CD-ROM; Academic Price: $710 fordownload, $800 for CD-ROM. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13649–13650. DOI: 10.1021/ja0697875. (i) Kerwin, S. M.ChemBioOffice Ultra 2010 Suite. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 2466–2467. DOI: 10.1021/ja1005306. (j) Milne, G. W. A. SoftwareReview of ChemBioDraw 12.0. J. Chem. Inf.Model. 2010, 50, 2053. DOI:10.1021/ci100385n. (k) Narayanaswamy, V. K.; Rissdörfer, M.; Odhav, B.Review on CambridgeSoft ChemBioDraw Ultra 13.0v. Int. J. Theor. Appl. Sci. 2013, 5, 43–49. [5] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA. 声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中可能存在疏漏错误，请不吝指正。
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