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[单晶结构] CIF中作者回应(Author Response)格式问题

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发表于 2025-9-24 07:22:57 | 查看全部 |阅读模式
CIF中作者回应(AuthorResponse)格式问题
晶体结构解析与精修过程中会遇到需要进行解释,也就是作者回应(Author Response)的警告,通常只需对AB类警告做出回应即可,作者回应的具体操作可查看如下视频:
有时会遇到多个相同PLAT序号的警告,如多个PLAT971AB类警告,如下图所示:
当使用PLATON进行Validation时,会生成一个vrf文件,用记事本的方式打开该vrf文件,如下图所示,列出了每一个PLAT971的作者回应格式:
如果对每个作者回应按下图填写,并将其粘贴于CIF中:
这样的格式去进行在线checkcif时,会有如下图所示的语法问题(Syntax problems)导致无法checkcif,这个语法问题就是CIF文件中不能包含重复的数据名称(Duplicate dataname),在本例中表现为具有重复的数据名称"_vrf_PLAT971_072412_sq",如下图所示:
其实可以将作者回应修改为如下图所示的格式,即,把所有的PROBLEM复制粘贴到第一个PROBLEM中,并将其余重复的数据名称"_vrf_PLAT971_072412_sq"删除,这样就可以避免数据名称重复问题:
也可以通过在checkcif时,根据需要勾选Output ValidationResponse Form选项,本例中仅对AB类警告进行回应,因此勾选第二项,如下图所示:
然后在checkcif报告中复制报告中红色文字内容,并将其粘贴于CIF中合适位置,并填写作者回应:
也可以将vrf文件中除第一个PLAT971外的其它PLAT971删除,仅保留第一条,并填写作者回应后将其复制粘贴于CIF中,如下图所示:
以上两种方法均没有问题。
不过有些小伙伴可能会发现,网页版的checkcif报告仅显示对第一个PLAT971的作者回应,如下图所示:
不过这个并没有问题,因为选择PDFcheckcif报告,则给出的是完整的作者回应,如下图所示:
视频版如下:
https://www.bilibili.com/video/BV1ES4y1p78E

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