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CCDC ConQuest晶体结构检索案例5(芘) 如图1所示，最近在B站上有小伙伴留言如何查询芘分子的晶体CIF[1]文件。 ▲图1 问题描述 芘分子结构如图2所示（由ChemBioDraw[2]绘制），英文名为pyrene，分子式为C16H10。 ▲图2 芘分子结构 可以利用结构式进行查询，在CCDCConQuest中点击Draw，绘制芘结构（也可以从ChemDraw中将结构式复制粘贴在CCDC ConQuest>>Draw中，然后添加氢原子），接着点击Draw界面右下角Search按钮，如图3所示。 ▲图3 通过芘结构式进行检索 点击Search后，进入检索设置界面，如图4所示，可以在筛选条件（Filters）中进行一些条件勾选以缩小范围，例如Not polymeric（非聚合物）、No ions（非离子）、Only>>Single crystal structures（仅限单晶结构）和Only>>Organics（仅限有机物），设置完成后，点击左下角的Start Search。 ▲图4 检索设置 检索结果共有304条，如图5所示，符合条件的共有18个（红框圈出）。 ▲图5 结构式检索结果 也可以利用名称进行检索，如图6所示，在CCDC ConQuest中点击Name/Class，在弹出的对话框Compound Name下输入pyrene，勾选Findexact word（检索精确词），点击下方的Add，名称被输入到Contains框，最后点击底下的Search。 ▲图6 名称检索设置 随后弹出检索设置对话框，可以进行筛选条件设置，如图7所示。 ▲图7 检索设置 检索结果247条，如图8所示，符合条件的符合条件的共有18个（红框圈出）。 ▲图8 名称检索结果 可以根据分子式检索，如图9所示，点击CCDC ConQuest中Formula，在弹出的对话框Formula下输入C16H10，底下的Formula applies to勾选an individual molecule（默认选项），取消勾选Other atoms allowed in molecule/structure（默认勾选），然后点击底下的Search。 ▲图9 分子式检索 如图10所示，同样进行筛选条件设置。 ▲图10 检索设置 检索结果354条，如图11所示，符合条件的符合条件的共有18个（红框圈出）。 ▲图11 分子式检索结果 因为芘名称pyrene比较简单，可以直接尝试将其名称作为Refcode进行检索，如图12所示，在CCDCConquest中点击Refcode(entry ID)，在弹出的对话框中输入PYRENE，点击右下角Find。 ▲图12 Refcode检索 结果如图13所示，直接定位到芘结构。 ▲图13 Refcode检索结果 视频演示操作请参阅： CCDC ConQuest晶体结构检索案例5(芘)：https://www.bilibili.com/video/BV1ura7zcEin 参考文献 [1] (a)Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File(CIF): A New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005. [2] (a)Klein, F. M. CS ChemDraw Pro,1 Version 3.1 for Windows. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1995, 35, 166–167. DOI: 10.1021/ci00023a026. (b)Cousins, K. R. ChemDraw 6.0 Ultra CambridgeSoft Corporation, 100 Cambridge ParkDrive, Cambridge, MA 02140. http://www.camsoft.com. Commercial Price: $1395.Academic Price: $699. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10257–10258. DOI: 10.1021/ja0047572.(c) Buntrock, R. E. ChemOffice Ultra 7.0. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2002, 42, 1505–1506. DOI: 10.1021/ci025575p. (d) Li, Z.; Wan, H.; Shi, Y.;Ouyang, P. Personal Experience with Four Kinds of Chemical Structure DrawingSoftware: Review on ChemDraw, ChemWindow, ISIS/Draw, and ChemSketch. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 1886–1890. DOI: 10.1021/ci049794h.(e) Mendelsohn, L. D. ChemDraw8 Ultra, Windows and Macintosh Versions. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2225–2226. DOI: 10.1021/ci040123t. (f) Cousins, K. R. ChemDrawUltra 9.0. CambridgeSoft, 100 CambridgePark Drive, Cambridge, MA 02140. www.cambridgesoft.com. See Web site for pricing options. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4115–4116. DOI:10.1021/ja0410237. (g) Zielesny, A. Chemistry Software PackageChemOffice Ultra 2005. J. Chem. Inf.Model. 2005, 45, 1474–1477. DOI:10.1021/ci050273j. (h) Mills, N. ChemDraw Ultra 10.0 CambridgeSoft, 100CambridgePark Drive, Cambridge, MA 02140. www.cambridgesoft.com. CommercialPrice: $1910 for download, $2150 for CD-ROM; Academic Price: $710 fordownload, $800 for CD-ROM. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13649–13650. DOI: 10.1021/ja0697875. (i) Kerwin, S. M.ChemBioOffice Ultra 2010 Suite. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 2466–2467. DOI: 10.1021/ja1005306. (j) Milne, G. W. A. SoftwareReview of ChemBioDraw 12.0. J. Chem. Inf.Model. 2010, 50, 2053. DOI:10.1021/ci100385n. (k) Narayanaswamy, V. K.; Rissdörfer, M.; Odhav, B.Review on CambridgeSoft ChemBioDraw Ultra 13.0v. Int. J. Theor. Appl. Sci. 2013, 5, 43–49. 声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中可能存在疏漏错误，请不吝指正。
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