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相关软件或概念：CCDC[1]; CIF[2] 最近某高校老师遇到如下审稿意见： Pleaseconfirm that the CCDC accession numbers will be made publicly available priorto your manuscript's publication. 大意是说让申请了CCDC号的晶体数据在论文发表之前在CCDC中公开。 在之前的推文“关于申请CCDC号的一点信息”中介绍过，晶体数据（CIF文件）自申请CCDC号之日起有一段时间的禁运期，在禁运期内只有申请该晶体数据CCDC号的账号可以查看该数据，其他人即便知道CCDC号也查不到该数据，例如CCDC号为2321180的晶体数据，申请CCDC号的日期是2023年12月21日，其禁运期到2024年10月21日，共计10个月。 在之前的推文“CCDC-有关CIF数据公开问题”中，有小伙伴遇到如何让审稿人通过CCDC号查询自己投稿的晶体数据的问题，审稿人一般查看的是提交给期刊的晶体数据。 正常情况下，晶体数据都是随着论文的发表，随后CCDC官网根据论文发表情况将晶体数据公开（即所有人均可通过CCDC号查询晶体数据），所以通常来说论文是先于晶体数据发表的。 不过前段时间，同单位某课题组老师投稿的时候，遇到晶体数据CIF文件大，超过了期刊投稿能够提交的文件大小，导致无法投稿，来询问编者CIF文件是否能够缩减什么的，编者给的建议是用压缩软件将其压缩为rar或zip等压缩文件进行上传。 无独有偶，最近又有一位高校老师遇到类似情况， 现在的先进仪器测试得到衍射文件经常很大，而且现在通常一篇论文工作量大，往往晶体数据都有很多个，再加上其他诸如核磁谱图等内容，一个工作要投稿时，发现要提交的文件太大，超出投稿系统限制。 包含了hkl和res文件的CIF文件通常比较大，而剔除hkl和res文件的话，CIF文件确实会小很多，但这与晶体数据要求有结构因子的大趋势相悖。其实有很多论文，其期刊主页作为附件提供的CIF文件不包含hkl和res文件，而上传到CCDC网的CIF则包含hkl和res文件，这也算是一个解决办法吧。 啰嗦了这么多，也该进入正题了，对于开头的那个审稿人要求晶体数据先于论文公开的审稿意见，编者感觉是解决CIF文件大小超过投稿系统限制的一个很好的解决方案。晶体数据在CCDC公开后，审稿人可以通过论文中提供的CCDC号自己去CCDC官网下载相关晶体数据查看并给出相关审稿意见（已公开的晶体数据是可以根据审稿意见修改后更新的，参考视频“如何更新已申请CCDC号且已发表的晶体数据：https://www.bilibili.com/video/BV14v4y177mF”），这样在投稿时就不需要上传大文件CIF了，可以省出不少空间用于上传其他文件。 对于已申请CCDC号，还未公开（Status为Unpublished）的晶体数据，点击左侧的Details。 点击Publishin a Database。 Authors一般填写申请CCDC号的人即可，或者把论文所有作者均填上，然后点击Save。 此时，晶体数据状态立即变为Published，晶体数据公开于CSD Communication数据库。等论文发表了之后，可以再回来在AddPublication中添加期刊信息，参阅视频“CCDC-更新已发表结构的期刊信息：https://www.bilibili.com/video/BV1SA41167XW”。 参考文献： [1](a) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a millioncrystal structures and rising. ActaCryst. 2002, B58, 380–388. (b) Allen, F. H. TheCambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures andrising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. [2](a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic InformationFile (CIF): a New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. (b)Hall, S. R. The STAR File: A New Format for Electronic Data Transfer andArchiving. J. Chem. Inf. Comput. Sci.1991, 31, 326–333. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. 如需PDF文档，请从以下链接下载： 通过网盘分享的文件：晶体数据审稿意见-在手稿前公开结构(CCDC).pdf
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发表于 2025-8-14 07:46:45
