无序示例-水和硝酸根混占无序

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无序示例-水和硝酸根混占无序

文本所用软件/程序

GUI: Olex2[1]    Structure refinement: SHELXL[2]

最近，北京某高校友友求助处理一个晶体数据，如图1所示。

▲图1 问题诉求

结构中有一个硝酸根做了二组分无序（0.537:0.463），但其N原子上差值电子密度图表明该处应该还有什么结构片段未指认，如图2所示。

▲图2 无序的硝酸根处差值电子密度图

结构中含有大量水分子，因此推测该处可能是水和硝酸根的混占无序，设计无序方案如图3所示，

▲图3 无序方案

按照无序方案实施无序处理，结果如图4所示，该处差值电子密度图较之前正常，MaxPeak从1.6降为1.0。

▲图4 无序处理结果

单独无序组分如图5所示。

▲图5 无序组分

参考文献

[1] Dolomanov, O.  V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,  Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.    [2] (a)  Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,  University of Göttingen, Germany, 2019. (b)  Sheldrick, G. M. A Short History of SHELX.  Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. Crystal Structure  Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle,  C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors  for SHELXL – model, implementation and  application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI:  10.1107/S2053273318013840.

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