无序示例-噻吩基二重无序

DJ_Tokyo

相关软件或概念：Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3)

最近处理一个数据，结构中存在2-噻吩基，其硫原子椭球偏大，而3-位碳原子则偏差小，电子云图表明该S原子应为比S更小的原子或非全占位S原子，该C原子应为比C更大的原子，也正因如此，Max Peak、R1和wR2等均居高不下，如图1所示。

▲图1 问题片段

这实际上是一种十分常见的噻吩取向无序，其无序方案如图2所示。

▲图2 无序方案

按照所设计的无序方案，对该噻吩基团做二组分无序，用SAME指令对两个无序组分的几何结构进行限制，用SIMU指令对相关原子的原子各向异性位移参数进行限制，最终结果如图3所示，各项指标参数均得到极大改善。

▲图3 无序处理结果

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

如需PDF文档，请从以下链接下载：

通过网盘分享的文件：无序示例-噻吩基二重无序.pdf

链接: https://pan.baidu.com/s/1pMJO1qE-WYS0kjh-kkOA1Q 提取码: qkdr