Olex2中在CIF中嵌入hkl和res数据

DJ_Tokyo

Olex2中在CIF中嵌入hkl和res数据

可能很多人在投稿时遇到上传CIF文件要求其中有相应合并的hkl和res数据，但许多人使用的Shelx[1]还是很早的版本，当前Shelx最新版本为2018/12，该版本程序可以在SHELX官网http://shelx.uni-goettingen.de/下载，免费注册后即可下载：

实际上2014及以上版本的Shelx默认将hkl和res文件嵌入到CIF文件中。2014版之前的Shelx精修的数据，其CIF文件中不包含hkl和res文件，不过有时需要上传fcf文件，即结构因子文件，该文件功能类似于hkl，例如Olex2自带数据Co110的fcf文件如下图所示：

该文件以国际晶体学会(IUCr, InternationalUnionof Crystallography)官方标准格式将hkl文件以loop形式保存，其中包含了h，k，l， Fc-squared (即Fc2), Fo-squared (即Fo2),sigma(Fo-squared) [即σ(Fo2)], status flag (状态标志)等七项内容。

如果精修程序选择的是ShelXL[2]，那么在Report设置中将HKL/RES设置为Leave as is即可：

精修得到CIF文件中自然包含hkl和res文件：

如果精修程序选择的是olex2.refine[3]，那么在Report设置中将HKL/RES设置为Include [IUCr]即可：

精修后CIF文件中会以loop的形式包含hkl、fcf等文件：

参考文献：

[1] Sheldrick, G. M. Acta Cryst. 2008, A64, 112-122.

[2] Sheldrick, G. M. Acta Cryst. 2015, A71, 3-8.

[3] Bourhis, L. J.; Dolomanov, O. V.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. ActaCryst. 2015, A71, 59-75.

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