晶体数据还原示例54(Rint)

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晶体数据还原示例54(Rint)

案例来源：CCDC[1] 2454232.DOI[2]:10.5517/ccdc.csd.cc2nctsn.

案例结构为2-氨基吡啶（2-Aminopyridine, CAS: 504-29-0），如图1所示（由ChemBioDraw[3]绘制）。

▲图1 案例结构

正常还原结果如图2所示（由Olex2[4]呈现），Rint = 30.84%。

▲图2 正常还原

该数据总共4轮数据，积分的平均相关系数如图3所示。

▲图3 每轮数据的平均相关系数

如图4所示为Reduce Data>>Scale>>Error Model部分截图，可以看出第4轮数据（fastscan）的Rint很高（51%），前3轮数据的Rint值则还好。

▲图4 Reduce Data>>Scale>>Error Model每轮数据的Rint值

对于这种情况，可以考虑将第4轮数据删除，有两种方法，第一种是重新还原数据，在Reduce Data>>Integrate Images删除第4轮数据，如图5所示，或者在Find Runs>>Select Runs对话框中取消选择第4轮数据，如图6所示。

▲图5 在已选择的数据列表中删除某轮数据

▲图6 在Select Runs对话框中取消勾选某轮数据

第二种方法则不需要重新还原数据，而是重新做吸收校正，到了Error Model步骤时，在Scan下方将第4轮数据取消勾选，然后点击右下角的Repeat Parameter Refinement，如图7所示。

▲图7 在Scale>>Error Model中取消勾选某轮数据并点击Repeat Parameter Refinement

再次进行到ErrorModel时，第4轮数据呈灰色，如图8所示，这表明将第4轮数据剔除掉了。

▲图8 剔除第4轮数据的结果

剔除掉第4轮数据后，Rint值从30.84%降为13.62%，如图9所示。

▲图9 剔除第4轮数据后的数据结果

视频操作：

单晶结构解析练习623(数据还原-Rint)：https://www.bilibili.com/video/BV17hK4zBEQA

数据下载：

链接:https://pan.baidu.com/s/1-7a79_Wlid4fqFhGMuIizQ

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参考文献

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