无序示例-氯和氯甲基混占无序(文献案例)

DJ_Tokyo

本文所用图形用户界面（GUI, GraphicalUser Interface）：Olex2[1]

本文所用结构精修程序：SHELXL[2]

案例来源：Chem. Eur. J. 2013, 19, 5665–5675.

DOI[3]：10.1002/chem.201204391.

CCDC[4]：913030

数据获取：

点击在Olex2中Home>>Start下最右侧的“…”图标，在弹出的Olex2 help对话框中点击“The ‘desordenadas’Jaca Structures”链接，如图1所示。

▲图1 案例数据获取

随后，点击jaca_B09下方的Get It Now下载数据，如图2所示。

▲图2 案例数据下载

数据下载下来，解析后如图3所示。

▲图3 解析初始模型

从Olex2下载的数据，没有具体结构信息，于是查到该结构所在论文“Chem. Eur. J. 2013, 19, 5665–5675.”从而知道了其结构，如图4所示，差值电子密度异常处是氯和氯甲基混占无序。

▲图4 案例结构无序方案

按照无序方案处理后，数据明显好多了，如图5所示。

▲图5 无序处理结果

视频操作演示请参阅：

Olex2无序Jaca结构B09解析(氯和氯甲基共占据无序)：https://www.bilibili.com/video/BV1Jf421D7qJ

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

[3](a) InternationalOrganization for Standardization (2012). ISO 26324:2012. Information and Documentation – Digital Object Identifier System.http://www.iso.org/iso/catalogue_detail.htm?csnumber=43506. (b) InternationalOrganization for Standardization (2022). ISO 26324:2022. Information and Documentation – Digital Object Identifier System. https://www.iso.org/standard/81599.html

[4](a) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a millioncrystal structures and rising. ActaCryst. 2002, B58, 380–388. (b) Allen, F. H. TheCambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures andrising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179.

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