无法消除的B级警报PLAT430

DJ_Tokyo

相关软件或概念：Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); PLATON[2] (Version: 241123); SHELXL[3] (Version: SHELXL-2019/3)

首先，看一下PLAT430警报（参阅推文“CheckCIF-PLAT430”）的触发条件，如图1所示，当供体原子核受体原子之间的距离小于其范德华半径之和减去0.2 Å时，它们之间如果没有氢原子则触发该警报。

▲图1 IUCr官网PLAT430释义

由此可知，触发条件是定死的，然而实际情况往往非常复杂。例如，某数据中一个硝基的氧原子（O3）和另一个硝基的氮原子（N2）之间的距离为2.774 Å，触发了该警报，如图2所示。很显然O3或者N2上不会有氢原子，因此这个B级警报是无法消除的，类似的情况也可见视频“CheckCIF-无法消除的PLAT430警报1：https://www.bilibili.com/video/BV1vu4y147bx”。

▲图2 B级警报PLAT430

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2] (a) Spek, A. L. Single-crystal structure validationwith the program PLATON. J. Appl.Cryst. 2003, 36, 7–13. (b) Spek,A. L. Structure validation in chemical crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. (c) Spek, A. L. What makes a crystal structure reportvalid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. (d) Spek, A. L. checkCIFvalidation ALERTS: what they mean and how to respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11.

[3](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/2, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

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