无序示例-金属二重无序(文献案例)

DJ_Tokyo

相关软件或概念：Olex2[1] (Version: Olex2-1.5); SHELXL[2] (Version: SHELXL-2019/3); PLATON[3] (Version: 60124)

案例来源：Nat. Commun. 2023, 14, 2968.

DOI：10.1038/s41467-023-38606-2

CCDC2245421的数据，金属附近有很大残余峰（MaxPeak 11.8），触发了AB级警报PLAT971（参阅推文“CheckCIF-PLAT971”）、PLAT972（参阅推文“CheckCIF-PLAT972”）和PLAT097（参阅推文“CheckCIF-PLAT097”），如图1所示。

▲图1 金属附近残余峰及其触发的AB级警报

该数据发表时对金属做了二组分无序处理，MaxPeak降为2.0，无AB级警报，如图2所示。

▲图2 金属无序处理结果

CCDC2208061的数据，金属附近有很大的残余峰（MaxPeak 13.5），R1和wR2居高不下，还有很多原子呈非正定，如图3所示。

▲图3 金属附近残余峰

这触发了很多的AB级警报，如图4所示。

▲图4 触发的AB级警报

论文发表时，对金属做了二组分无序处理，剩一个数据参数比低的B级警报PLAT090（参阅推文“CheckCIF-PLAT090”），如图5所示。

▲图5 金属无序处理结果

视频操作演示请参阅：

金属无序案例1(文献)：https://www.bilibili.com/video/BV15642137Bm

金属无序案例2(文献)：https://www.bilibili.com/video/BV17J4m1t77g

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

[3] (a) Spek, A. L. Single-crystal structure validationwith the program PLATON. J. Appl.Cryst. 2003, 36, 7–13. (b) Spek,A. L. Structure validation in chemical crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. (c) Spek, A. L. What makes a crystal structure reportvalid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. (d) Spek, A. L. checkCIFvalidation ALERTS: what they mean and how to respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11.

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